| 宁乡猪皮下脂肪与肌内脂肪组织转录组差异分析 |
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| 引用本文： | 王芳,张跃博,蒋谦,印遇龙,谭碧娥,陈家顺.宁乡猪皮下脂肪与肌内脂肪组织转录组差异分析[J].遗传,2023(12):1147-1157. |
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| 作者姓名： | 王芳 张跃博 蒋谦 印遇龙 谭碧娥 陈家顺 |
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| 作者单位： | 1. 湖南农业大学动物科学技术学院,动物营养基因组与种质创新研究中心;2. 农业农村部畜禽资源(猪)评价利用重点实验室;3. 畜禽产品品质调控湖南省重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(编号:2021YFD1300403)；;国家自然科学基金项目(编号:32302761,U20A2054)；;湖南省自然科学基金项目(编号:2022JJ40165)；;国家生猪产业技术体系建设专项(编号:CARS-35)；;湖南省教育厅优秀青年基金项目(编号:22B0206)资助~~； |
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| 摘 要： | 为了比较分析宁乡猪皮下脂肪(subcutaneous fat,SAF)和肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)组织脂肪沉积的分子机制，本文利用RNA-seq技术鉴定和分析宁乡猪SAF和IMF组织中差异基因表达谱。选取6头250日龄健康状况良好、种内个体体重相近(约85 kg)的雄性宁乡猪为实验材料，采集SAF与IMF组织样品。通过对两个脂肪组织转录组测序并进行GO(Gene Ontology)功能注释及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路富集分析，得到与脂肪沉积和脂质代谢相关的差异基因。为验证测序数据结果的可靠性，本研究随机选取6个差异基因进行qRT-PCR验证。结果表明，宁乡猪SAF和IMF组织中有2406个基因差异表达，其中1422个基因表达上调，984个基因表达下调。通过GO功能注释分析发现，差异表达基因主要通过参与类固醇生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、甘油磷脂代谢及自噬途径等与脂质代谢相关途径，调控宁乡猪SAF和IMF的沉积。KEGG通路富集结果显示，差异基因主要富集在脂质结合、脂肪酸代谢过程、甘油...
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| 关 键 词： | 宁乡猪 肌内脂肪 皮下脂肪 RNA-seq 差异表达基因 |
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