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远交群体动态性状基因定位的似然分析Ⅱ.模拟研究
作者姓名:杨润清  高会江  孙华  Shizhong Xu
作者单位:1. 上海交通大学农业与生物学院,上海,201101
2. 东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030
3. Department of Botany & Plant Science,University of California,Riverside CA 92521,USA
摘    要:以远交设计群体为例,在推导出动态性状基因定位的似然法分析过程的基础上,选择3阶Legendre多项式为子模型,采用Monte-Carlo方法模拟研究了不同个体数、测定日频数、标记密度和QTL遗传贡献率对两种分析方法检测QTL效率的影响。每个因素都取高、中和低3个水平,利用正交设计安排模拟因素试验组合。模拟试验结果表明:高QTL遗传贡献率要比低QTL遗传贡献率的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样;但不论QTL遗传贡献率多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日频数都可以保证足够高的检测效率。个体数和测定日频数对动态性状QTL的分析和检测具有几乎相同的作用,而且相同样本含量条件下两者呈现互补的关系。就某个动态点的QTL检测而言,模拟试验也同时证明:提出的这种以整个动态过程为定位目标的动态性状基因定位方法明显优于传统的逐个动态点的定位分析方法。

关 键 词:动态性状 基因定位 Legendre多项式 极大似然法 模拟
文章编号:0379-4172(2004)11-1254-08
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