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腾冲嗜热厌氧杆菌tte0732基因的表达及生物信息学分析
引用本文:刘原子,王艳,王川,吴润,万学瑞,吴自祥.腾冲嗜热厌氧杆菌tte0732基因的表达及生物信息学分析[J].微生物学杂志,2018(1):42-49.
作者姓名:刘原子  王艳  王川  吴润  万学瑞  吴自祥
作者单位:甘肃农业大学动物医学院;
基金项目:国家自然科学基金项目(31500067)
摘    要:腾冲嗜热厌氧杆菌tte0732(Galu)基因编码的TTE0732是温度依赖性蛋白。为研究其在热适应中的作用,应用PCR技术克隆腾冲嗜热厌氧菌tte0732基因,构建原核表达载体pET-28a::tte0732并在大肠埃希菌BL21表达TTE0732;通过qRT-PCR分析tte0732基因在50、60、75和80℃的RNA表达量;应用生物信息学软件分析Galu在嗜热菌和常温菌中编码氨基酸的基本理化性质。成功构建了原核表达载体pET-28a::tte0732并在大肠埃希菌BL21中得到高效表达,TTE0732分子质量大小为35 ku,主要以可溶性形式存在;qRT-PCR显示tte0732 mRNA在75和80℃高表达;生物信息学分析得出tte0732基因完整的ORF全长909 bp,编码302个氨基酸,其中Ile(I)、Leu(L)含量高于常温菌,编码蛋白为酸性亲水性蛋白,等电点为5.22,含有18个潜在的磷酸化位点,不存在跨膜结构、信号肽和糖基化位点。预测其蛋白质二级空间结构以α-螺旋、无规则卷曲、β-折叠为主。腾冲嗜热厌氧杆菌TTE0732蛋白是一种亲水性蛋白,在原核系统能高效表达,本研究结果对嗜热蛋白质的热稳定性机制的研究具有一定的参考。

关 键 词:腾冲嗜热厌氧菌    tte0732基因  原核表达  生物信息学分析  qRT-PCR

Expression and Bioinformatics Analysis of Thermoanaerobacter tengcongensis tte0732 Gene
LIU Yuan-zi,WANG Yan,WANG Chuan,WU Run,WAN Xue-rui and WU Zi-xiang.Expression and Bioinformatics Analysis of Thermoanaerobacter tengcongensis tte0732 Gene[J].Journal of Microbiology,2018(1):42-49.
Authors:LIU Yuan-zi  WANG Yan  WANG Chuan  WU Run  WAN Xue-rui and WU Zi-xiang
Institution:Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070,Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070,Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070,Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070,Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070 and Coll. of Anim. Med., Gansu Agric. Uni., Lanzhou 730070
Abstract:
Keywords:Thermoanaerobacter tengcongensis  tte0732  prokaryotic expression  bioinformatics analysis  qRT-PCR
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