| 西南印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的富集分离与多样性分析 |
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| 引用本文： | 陈双喜,邵宗泽. 西南印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的富集分离与多样性分析[J]. 微生物学报, 2008, 48(10): 1351-1355 |
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| 作者姓名： | 陈双喜 邵宗泽 |
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| 作者单位： | 国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物遗传重点实验室,厦门,361005 |
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| 基金项目： | 中国大洋矿产资源研究开发协会科研项目，国家自然科学基金，国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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| 摘 要： | [目的]为了筛选深海砷抗性菌,了解印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的多样性情况.[方法]通过砷富集培养,筛选出砷抗性菌;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析与构建16S rDNA克隆文库法两种手段分析了富集物中砷抗性菌的多样性.利用兼并引物PCR,从抗性菌株中克隆与砷抗性相关的基因.[结果]共筛选到8株砷抗性菌,分别属于y-proteobacteria的5个不同的属.其中,菌株AS-I1-3的抗性最高,可以在26×10-3 mol/L三价砷存在的情况下生长,该菌株的16S rDNA序列与菌株Pseudoalteromonas tetraodoni IAM同源性最高(100%).DGGE分析显示,该菌是富集物中的最优势菌,其次是盐单胞菌(Halomonas)和海杆菌(Marinobacter).16S rDNA克隆文库分析结果进一步证明,与菌株AS-I1-3序列相同的克隆子占整个克隆文库的72.5%;而与菌株AS-I1-5(Halomonas meridiana,100%)和菌株Mn-I1-6(Marinobacter vinifirmus,99%)序相同的克隆子分别占10%和7.5%.然而,利用兼并引物PCR,仅能从2株非优势菌中克隆到了与砷抗性相关的基因,表明菌群中的优势抗性菌可能有其他的抗性机制.[结论]在深海环境中存在着多种砷抗性菌,其中Pseudoalteromonas属的菌株是该富集条件下的砷抗性优势菌.这些砷抗性菌在大洋环境砷元素的生物地球化学循环中的作用有待进一步研究.
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| 关 键 词： | 印度洋 深海沉积物 砷抗性菌 生物多样性 |
| 修稿时间： | 2008-06-05 |
Enrichment and diversity analyis of arsenite-resistant bacteria in deep sea sediment samples from southwest Indian Ocean ridge |
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| Shuangxi Chen and Zongze Shao. Enrichment and diversity analyis of arsenite-resistant bacteria in deep sea sediment samples from southwest Indian Ocean ridge[J]. Acta microbiologica Sinica, 2008, 48(10): 1351-1355 |
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| Authors: | Shuangxi Chen and Zongze Shao |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Marine Biogenetic Resources, The Third Institute of Oceanography, State Oceanic Administration, Xiamen 361005, China;Key Laboratory of Marine Biogenetic Resources, The Third Institute of Oceanography, State Oceanic Administration, Xiamen 361005, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Indian Ocean deep-sea sediment arsenite-reistant bacteria diversity |
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