| 龙眼miR396分子进化特性及响应蓝光的表达分析 |
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| 引用本文： | 李汉生,孙 刚,陈晓慧,姚德恒,林玉玲,赖钟雄.龙眼miR396分子进化特性及响应蓝光的表达分析[J].西北植物学报,2019,39(12):2109-2122. |
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| 作者姓名： | 李汉生 孙 刚 陈晓慧 姚德恒 林玉玲 赖钟雄 |
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| 作者单位： | (1 福建农林大学 园艺植物生物工程研究所，福州350002；2 三明学院 资源与化工学院，福建三明365004) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31572088，31672127)； |
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| 摘 要： | 关于蓝光对龙眼胚性愈伤组织miRNA组学研究中发现大量响应蓝光的miRNAs,挑选关键且差异表达的miR396a-3p_2和miR396b-5p进行分子进化特性分析,以进一步明确它们在龙眼响应蓝光过程中的作用。该研究对前体和成熟体进化树、前体二级结构、启动子顺式作用元件、靶基因预测及其响应蓝光表达模式等进行分析。结果表明:(1)由5p臂上形成的miR396成熟体序列保守性较高,由3p臂上形成的miR396成熟体序列特异性较大;茎序列的保守性高于环序列,5p臂上保守性高于3p臂。(2)miR396a-3p_2和miR396b-5p的启动子主要包括光、激素、生物和非生物胁迫响应元件,可能通过这些顺式元件在龙眼响应蓝光中起调控作用;其响应蓝光的靶基因或蛋白主要包括生长素调控因子(GRF2)、LRR类受体丝氨酸(FLS2)、乙烯不敏感蛋白(EIN3)和DNA定向RNA聚合酶α亚基(rpoA)等。(3)实时荧光定量PCR结果表明,miR396a-3p_2和miR396b-5p在不同光质的表达模式存在差异;在不同光强的蓝光条件下,miR396b-5p与其靶基因的表达趋势基本呈负相关,而miR396a-3p_2与rpoA的表达趋势未呈负相关,可能存在其他miR396家族成员或miRNAs同时调控,从而实现靶基因转录水平的调控。
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| 关 键 词： | 龙眼 miR396 进化特性 蓝光 实时荧光定量PCR |
Analysis on Evolutionary Characteristics and Expression Patterns of miR396 Responding to Blue Light in Dimocarpus longan |
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| LI Hansheng,SUN Gang,CHEN Xiaohui,YAO Deheng,LIN Yuling,LAI Zhongxiong.Analysis on Evolutionary Characteristics and Expression Patterns of miR396 Responding to Blue Light in Dimocarpus longan[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2019,39(12):2109-2122. |
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| Authors: | LI Hansheng SUN Gang CHEN Xiaohui YAO Deheng LIN Yuling LAI Zhongxiong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dimocarpus longan miR396 evolution blue light real time quantitative PCR |
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