SNF2家族新成员Ercc6l的cDNA克隆与表达分析(英) |
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作者姓名: | 陈祥贵 李勇 臧明玺 裴新荣 许雅君 高丽芳 |
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作者单位: | 北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083;西华大学生物工程系,成都 610039;北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083;北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083;北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083;北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083;北京大学公共卫生学院营养学系,北京大学分子毒理与发育分子生物学实验室,北京 100083 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展规划项目(973)(G1999055904),国家自然科学基金资助项目(30030120)和北京大学“985”项目资助. |
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摘 要: | SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用. 报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like)的cDNA克隆、特性与表达分析.通过表达序列标签(EST)搜索和组装,获得了cDNA全长4 002 bp的新基因Ercc6l(GenBank Acc.No AY172688),然后通过RT-PCR在小鼠胚胎心脏成功克隆了该基因.Ercc6l在小鼠基因组中由两个外显子和一个内含子组成,定位于X染色体,最大开放阅读框(ORF)编码一个含1 240个氨基酸的假定蛋白质.该假定蛋白质含有SNF2蛋白的8个保守基序(SNF2结构域).通过与SNF2家族各亚家族的成员进行多重比对,初步确认Ercc6l属于ERCC6亚家族成员.将Ercc6l编码区克隆到pEGFP-C3然后转染HeLa,3T3 和B16细胞,融合蛋白主要定位于胞浆.BLAST搜索检索出69条小鼠EST与Ercc6l同源,这些EST主要来自胚胎和肿瘤组织.对小鼠不同发育时期的多种组织进行RT-PCR,发现Ercc6l在胚胎期强表达,出生产后表达显著下调.这些结果提示Ercc6l在胚胎发育和肿瘤发生中可能具有重要作用.
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关 键 词: | Ercc6l 基因克隆 SNF2蛋白 表达谱 亚细胞定位 |
收稿时间: | 2003-10-31 |
修稿时间: | 2003-12-28 |
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