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基于叶绿体基因多样性的中国水稻起源进化研究
引用本文:王荣升,杨庆文.基于叶绿体基因多样性的中国水稻起源进化研究[J].植物遗传资源学报,2011,12(5):686-693.
作者姓名:王荣升  杨庆文
作者单位:中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081
基金项目:农业部财政专项“农业野生植物保护与可持续利用”;转基因重大专项“转基因水稻环境安全评价”(2008ZX08011-001)
摘    要:针对目前亚洲栽培稻起源地和进化途径学说众多、分歧巨大的现状,本研究选择原产中国的98份亚洲栽培稻和125份普通野生稻为材料,对叶绿体中atpA序列、rps16内含子序列、trnP-rpl33间隔区、trnG-trnfM序列、trnT-trnL间隔区序列的五段高突变序列进行测序,利用生物信息学方法进行比对分析,绘制Network网络图,构建系统发育树。结果表明,普通野生稻的Indel和SNP数目均比亚洲栽培稻多,序列多样性丰富;基于单倍型的Network网络图和系统发育树可将所有参试材料归为3个类群,类群I主要为粳稻与普通野生稻,类群II主要为籼稻,类群III主要为普通野生稻,而类群II和类群III亲缘关系较近,提示粳、籼两个亚种可能由偏粳、偏籼的普通野生稻分别进化而来,支持二次起源学说;所有与亚洲栽培稻亲缘关系较近的普通野生稻均来源于华南地区,支持华南地区为我国亚洲栽培稻起源中心的论点。

关 键 词:水稻  叶绿体  基因多样性  起源  籼粳分化
收稿时间:5/3/2011 3:22:05 PM
修稿时间:2011/5/28 0:00:00

Study on the Origin and Evolution of Cultivated Rice in China Based on Gene Diversity of Chloroplast Genome
wangrongsheng and.Study on the Origin and Evolution of Cultivated Rice in China Based on Gene Diversity of Chloroplast Genome[J].Journal of Plant Genetic Resources,2011,12(5):686-693.
Authors:wangrongsheng and
Institution:China academy of agriculture sciences,
Abstract:
Keywords:Rice  Chloroplast  Gene Diversity  Origin  Indica-japonica differentiation
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