应用关联分析鉴定大豆对斜纹夜蛾的抗性基因

用135个分布于全基因组的SSR（simple sequence repeat）标记分析196份大豆（Glycine max）地方品种的遗传变异、群体结构和连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）。在考虑群体结构的条件下,应用全基因组关联分析的方法鉴定与大豆抗斜纹夜蛾有关的数量性状位点,进而发掘各关联位点的优异等位基因及代表性载体材料。结果表明：（1）该群体不仅地理起源广,而且遗传变异丰富;（2）在整个群体内,有17.9%的标记对处于显著的连锁不平衡,而且在相同染色体上标记对间连锁不平衡延伸的平均距离约为6.61cM（D＇〉0,P〈0.05）;（3）通过关联分析发现,有7个SSR标记分别与3个大豆抗斜纹夜蛾性状关联（P〈0.01）,其中4个位点对性状的变异解释率超过了10%,6个位点所在的连锁群上存在已报道的食叶性害虫抗性位点;（4）各位点等位基因的效应分析显示,幼虫重相关位点的等位基因主要表现为减效作用,等位基因Sat_334-A208减效作用最大（43.9%）;单虫食叶量和蛹重相关位点的等位基因主要表现为增效作用;等位基因Satt199-A186对单虫食叶量增效作用最大（36.4%）;等位基因Sat_320-A286对蛹重增效作用最大（31.4%）。

Identification of Genes with Soybean Resistance to Common Cutworm by Association Analysis

We used 135 genome-wide simple sequence repeat(SSR) markers to assess genetic diversity,population structure and linkage disequilibrium(LD) of 196 soybean landraces.On the basis of estimated population structure,we conducted association mapping for soybean resistance to common cutworm(CCW) using genomic-wide mapping strategies and detected the elite alleles of soybean resistance to CCW,along with their carriers.In addition to wide geographic origin,the population showed extensive genetic variation,and 17.9%...