| 二斑叶螨和肩突硬蜱基因组微卫星分布规律研究 |
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| 引用本文： | 汪自立,黄杰,杜联明,李午佼,岳碧松,张修月.二斑叶螨和肩突硬蜱基因组微卫星分布规律研究[J].四川动物,2013(4):481-486. |
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| 作者姓名： | 汪自立 黄杰 杜联明 李午佼 岳碧松 张修月 |
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| 作者单位： | 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室,四川大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31272039) |
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| 摘 要： | 本研究利用已公布的二斑叶螨Tetranychus urticae和肩突硬蜱Ixodes scapularis的全基因组测序结果,对其基因组中的微卫星序列进行了系统分析和比较。结果表明:在二斑叶螨基因组中共找到微卫星7934个,出现频率为1/11.45kb,占全基因组碱基总数的0.16%,其中三碱基重复微卫星最多,占总数的72.83%;在肩突硬蜱基因组中共找到550629个微卫星,出现频率为1/3.21kb,占全基因组碱基总数的0.57%,其中单碱基重复微卫星最多,占总数的73.74%。另外,肩突硬蜱基因组中微卫星的重复次数普遍高于二斑叶螨基因组中微卫星的重复次数,二斑叶螨基因组中微卫星的GC含量(34.10%)明显高于肩突硬蜱(24.35%)。微卫星家族方面,二斑叶螨基因组倾向拥有更多的唯一序列(P<0.0001)。A、T、AG、TC、TG、GAT、ATTT、AATA是两个物种共有的常见核心重复序列。
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| 关 键 词： | 二斑叶螨 肩突硬蜱 基因组 微卫星 特征分析 |
Comparison of Microsatellites between the Genomes of Tetranychus urticae and Ixodes scapularis |
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| WANG Zili # ,HUANG Jie # ,DU Lianming,LI Wujiao,YUE Bisong,ZHANG Xiuyue.Comparison of Microsatellites between the Genomes of Tetranychus urticae and Ixodes scapularis[J].Sichuan Journal of Zoology,2013(4):481-486. |
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| Authors: | WANG Zili # HUANG Jie # DU Lianming LI Wujiao YUE Bisong ZHANG Xiuyue |
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| Institution: | * ( Sichuan Key Laboratory of Conservation Biology on Endangered Wildlife,College of Life Science, Sichuan University,Chengdu 610064,China) |
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