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链状亚历山大藻共附生细菌多样性
引用本文:刘兵,李宇,叶倩,李太武,苏秀榕,李登峰,陈燕,史西志.链状亚历山大藻共附生细菌多样性[J].生态学杂志,2009,28(5):889-894.
作者姓名:刘兵  李宇  叶倩  李太武  苏秀榕  李登峰  陈燕  史西志
作者单位:1. 宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波,315211
2. 宁波海事局,浙江宁波,315020
基金项目:浙江省重大科技攻关项目,浙江省教育厅重点项目 
摘    要:采用非分离培养分析方法,直接提取链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)共附生细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析,得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明,链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强,优势细菌类群为变形菌α亚群(α-Proteobacteria)和拟杆菌(Bacteroidetes),其中玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)在α-Proteobacteria中占绝对优势。

关 键 词:链状亚历山大藻  细菌多样性
收稿时间:2008-9-1

Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella
LIU Bing,LI Yu,YE Qian,LI Tai-wu,SU Xiu-rong,LI Deng-feng,CHEN Yan,SHI Xi-zhi.Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella[J].Chinese Journal of Ecology,2009,28(5):889-894.
Authors:LIU Bing  LI Yu  YE Qian  LI Tai-wu  SU Xiu-rong  LI Deng-feng  CHEN Yan  SHI Xi-zhi
Abstract:
Keywords:16S rDNA  RFLP
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