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北极狐GHR基因cDNA的克隆及序列分析
引用本文:杜智恒,宁方勇,杨春山,白秀娟.北极狐GHR基因cDNA的克隆及序列分析[J].兽类学报,2010,30(1).
作者姓名:杜智恒  宁方勇  杨春山  白秀娟
作者单位:东北农业大学动物科技学院,哈尔滨,150030
摘    要:本文根据狗(AF133835)的GHR基因cDNA编码全序列设计了三对引物,利用RT-PCR方法克隆出北极狐GHR基因编码区全长cDNA序列(GenBank accession No.EU304325)。结果表明,北极狐GHR的ORF为1917bp,编码638个氨基酸的前体蛋白,由18个氨基酸的信号肽和620个氨基酸的成熟肽组成。通过同源性比较发现北极狐与狗的同源性最高,达到98%。另外,利用邻接法(NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,北极狐与狗先聚为一类,该聚类结果与传统的物种进化关系基本一致。另外,通过氨基酸对位序列比较发现,北极狐GHR在氨基酸序列上存在明显的特异性,如45和451位分别为A和E,而其它物种均分别为T(大鼠为K)和A(牛羊为V,鼠为T)。

关 键 词:北极狐  GHR基因  克隆  序列分析

cDNA cloning and sequence analysis of growth hormone receptor (GHR) from Arctic fox
DU Zhiheng,NING Fangyong,YANG Chunshan,BAI Xiujuan.cDNA cloning and sequence analysis of growth hormone receptor (GHR) from Arctic fox[J].Acta Theriologica Sinica,2010,30(1).
Authors:DU Zhiheng  NING Fangyong  YANG Chunshan  BAI Xiujuan
Institution:DU Zhiheng,NING Fangyong,YANG Chunshan,BAI Xiujuan(College of Animal Science , Technology,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)
Abstract:In the current study, the gene encoding growth hormone receptor (GHR) was cloned by RT-PCR from Arctic fox (Alopex lagopus) according to dog GHR gene (AF133835). Sequence analysis revealed that the open reading frame(ORF)of Arctic fox GHR is 1 917 bp, which encodes a 638-amino acid precursor containing a signal peptide of 18 amino acids and a mature peptide of 620 Amino acids. Arctic fox GHR gene has highest similarity(98%) with dog GHR.The molecular phylogenetic tree was constructed by the NJ method based ...
Keywords:Arctic fox (Alopex lagopus)  Cloning  CHR gene  Sequence analysis
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