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黄独微型块茎鲨烯合酶的基因克隆与序列分析
引用本文:柯维忠,钟雯娟,刘凯盈,李祥媛,尹明华.黄独微型块茎鲨烯合酶的基因克隆与序列分析[J].植物研究,2021(2).
作者姓名:柯维忠  钟雯娟  刘凯盈  李祥媛  尹明华
作者单位:上饶师范学院生命科学学院
基金项目:2019年度江西省教育厅科学技术研究一般项目(GJJ190877);国家自然科学基金项目(31360072)。
摘    要:通过黄独微型块茎转录组数据库筛选到SQS基因的核心片段,利用RT-PCR技术获得SQS基因保守片段,采用RACE技术获得SQS基因的3′及5′末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果表明,黄独微型块茎SQS基因编码序列长1548 bp,编码415 bp的氨基酸序列,理论分子量为46786.38 D,等电点(pI)为5.97。SQS蛋白为疏水性蛋白,无信号肽,含有SQS所必需的功能结构域,属于Isoprenoid_Biosym_C1 superfami?ly。黄独SQS蛋白与其他植物的SQS蛋白同源性较高,其中与盾叶薯蓣的SQS蛋白氨基酸相似性为96.4%。本试验结果从黄独微型块茎中首次获得SQS基因cDNA全长序列,该基因具有SQS同源基因的典型特征,为进一步研究黄独微型块茎SQS基因结构、基因表达和基因突变提供了基础,并为薯蓣属植物三萜合成通路关键酶SQS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持。

关 键 词:黄独  微型块茎  鲨烯合酶  基因克隆  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of Squalene Synthase(SQS)Gene from Dioscorea bulbifera L.Microtuber
KE Wei-Zhong,ZHONG Wen-Juan,LIU Kai-Ying,LI Xiang-Yuan,YIN Ming-Hua.Cloning and Sequence Analysis of Squalene Synthase(SQS)Gene from Dioscorea bulbifera L.Microtuber[J].Bulletin of Botanical Research,2021(2).
Authors:KE Wei-Zhong  ZHONG Wen-Juan  LIU Kai-Ying  LI Xiang-Yuan  YIN Ming-Hua
Institution:(College of Life Sciences,Shangrao Normal University,Shangrao 334001)
Abstract:
Keywords:Dioscorea bulbifera L    microtuber  squalene synthase(SQS)  gene cloning  sequence analysis
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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