汉滩病毒A9株强毒和弱毒克隆M基因片段G1糖蛋白编码区核苷酸序列的分析比较 |
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引用本文: | 邱建明,杭长寿,宋干,姚树元,李盈盈,鲁晓岚.汉滩病毒A9株强毒和弱毒克隆M基因片段G1糖蛋白编码区核苷酸序列的分析比较[J].病毒学报,1996(3). |
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作者姓名: | 邱建明 杭长寿 宋干 姚树元 李盈盈 鲁晓岚 |
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作者单位: | 中国预防医学科学院病毒学研究所,西安医科大学附属第一医院 |
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摘 要: | 采用逆转录-PCR方法,用3对引物分3个片段扩增强毒克隆(A9v)及弱毒克隆(A3%)的M基因片段cDNA,并克隆入pGEM-T载体中。采用Sanger双脱氧法测定了A39s、A9v病毒G1糖蛋白编码区的全序列,发现二者均由1978个核苷酸组成,比76/118株少6个核苷酸,并发现A39s在G1编码区有33个碱基及8个氨基酸与A9v不同。进一步与76/118、HV114的相关序列比较,发现G1编码区的第606、614位氨基酸的变异同A39s病毒的减毒有一定相关。从A39s、A9v、76/118及HV1144株病毒G1糖蛋白编码区推导的氨基酸序列亲疏水性资料显示,在位于G1糖蛋白C末端的最大亲水区域的600~620位氨基酸区域,弱毒株A39s同强毒株A9v、76/118、HV114的亲水性有明显不同,而这一差异又主要由第614位氨基酸的变异所引起。因此推测,G1糖蛋白C端亲水区域同汉滩病毒毒力相关,而第614位的精氨酸被谷氨酰胺取代,同A39s病毒毒力的减弱可能有关。
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关 键 词: | 汉滩病毒,cDNA克隆,序列分析,毒力相关位点 |
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