江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A2正交晶型Ⅰ--0.25nm分辨率晶体结构 |
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引用本文: | 赵克浩,宋时英,林政炯,周元聪.江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A2正交晶型Ⅰ--0.25nm分辨率晶体结构[J].中国科学C辑,1999,29(3). |
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作者姓名: | 赵克浩 宋时英 林政炯 周元聪 |
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作者单位: | 1. 中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室,北京,100101 2. 中国科学院上海生物化学研究所,上海,200031 |
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摘 要: | 江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A2具有强烈的溶血及抗凝血活性.运用刚体修正技术获得了正交晶型Ⅰ中分子的精确旋转与平移参数.采用非晶体学二重对称性制约的最小二乘修正方法在0.6~0.25 nm分辨率范围内进行了结构精化.最终的晶体学R因子为20.1%, 键长、键角与标准值的均方根偏差分别为0.0013 nm和1.55°.与正交晶型Ⅱ结构比较表明,二者除了β-折叠部位与Ca2+结合部位构象存在小的差别外,磷脂酶A2分子主体构象极其相似.2种晶型由不对称单位中2个分子形成的二体也是类似的.但是,二体中1个单体分子的相对取向有5.5°的差别,提示二体结合面有一定柔性.晶型Ⅰ二体较晶型Ⅱ二体在晶胞中的堆积更紧密.
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关 键 词: | 磷脂酶A2 二体 溶血活性 |
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