木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析 |
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作者姓名: | 李建君 郭鑫 林晨俞 王文娟 高苗苗 陈银华 于晓惠 |
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作者单位: | 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室, 海南大学热带作物学院, 海口 570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口 570228 |
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基金项目: | 国家木薯产业技术体系项目(No. CARS-11-HNCYH)资助 |
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摘 要: | 植物铁蛋白(Ferritin, FER)既能存储铁,又能响应各种非生物胁迫。该研究基于全基因组水平对木薯(Manihot esculenta)的FER基因家族进行分析,结果表明,从木薯中共鉴定到4个FER基因,根据系统发育树将木薯FER基因划分为2支,所有成员均包含Euk_Ferritin的功能结构域并位于叶绿体内。木薯FERs基因位于LG7~LG10染色体上;基因共线性分析表明,共有3对潜在的复制基因对,无串联重复事件;Ka/Ks值表明,MeFER同源基因经过了纯化选择;该家族含有响应激素和胁迫诱导的顺式作用元件;q RT-PCR分析表明,MeFER基因的表达具有组织特异性,MeFER4基因响应多种胁迫,且在干旱胁迫下响应最为显著。该研究为木薯FER基因家族的功能研究奠定了基础。
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关 键 词: | 木薯 FER基因 生物信息学分析 非生物胁迫 |
收稿时间: | 2022-12-07 |
修稿时间: | 2023-03-09 |
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