| 基于转录组测序的羽衣甘蓝叶色相关基因分析 |
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| 引用本文： | 王玉书,王欢,范震宇,陈阳,金一锋,高美玲. 基于转录组测序的羽衣甘蓝叶色相关基因分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2020, 39(1): 200-206 |
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| 作者姓名： | 王玉书 王欢 范震宇 陈阳 金一锋 高美玲 |
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| 作者单位： | 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,齐齐哈尔,161006;抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室,齐齐哈尔,161006;齐齐哈尔大学化学与化学工程学院,齐齐哈尔,161006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;黑龙江省自然科学基金;创新人才培养计划;基本科研业务费项目 |
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| 摘 要： | ![]()
叶色是羽衣甘蓝重要的观赏性状之一。本研究采用Illumina Hi-Seq2500高通量测序技术,对基因型纯合的紫叶和白叶羽衣甘蓝叶片进行转录组测序,筛选差异基因并与GO和KEGG数据库比对进行注释分析,分析羽衣甘蓝叶色形成相关基因。结果显示,获得高质量短读序共104 608 770条,筛选出紫叶相对白叶的差异表达基因1 993个,其中上调表达基因1 094个,下调表达基因899个。根据GO功能分类可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类64功能组。根据KEGG代谢通路分析可以分为171类,在叶色相关的类黄酮生物合成途径中黄酮醇合成酶(FLS)、二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)上调以及类胡萝卜素生物合成途径中的类胡萝卜素β-环化酶上调与紫叶形成关系密切。本研究丰富了羽衣甘蓝的转录组信息,获得了一些差异表达基因,为进一步研究羽衣甘蓝叶色形成的遗传机制提供了有价值的信息。
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| 关 键 词： | 羽衣甘蓝 叶色 转录组 差异表达基因 |
Identifying Genes Associated with Leaf Color in Kale(Brassica oleracea L.var.acephala DC.) Based on Transcriptome Analysis |
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| Wang Yushu,Wang Huan,Fan Zhenyu,Chen Yang,Jin Yifeng,Gao Meiling. Identifying Genes Associated with Leaf Color in Kale(Brassica oleracea L.var.acephala DC.) Based on Transcriptome Analysis[J]. Genomics and Applied Biology, 2020, 39(1): 200-206 |
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| Authors: | Wang Yushu Wang Huan Fan Zhenyu Chen Yang Jin Yifeng Gao Meiling |
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| Affiliation: | (College ofLife Sciences,Agriculture and Forestry Qiqihaer University,Qiqihaei,161006;Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Resistance Gene Engineering and Preservation of Biodiversity in Cold Areas,Qiqihaer,161006;College of Chemistry and Chemical Engineering,Qiqihaer University,Qiqihaer,161006) |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | |
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