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| 拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析 | |
| 引用本文： | 郝岗平,吴忠义,曹鸣庆,黄丛林,杨清. 拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析[J]. 遗传学报, 2004, 31(12): 1415-1425 |
| 作者姓名： | 郝岗平 吴忠义 曹鸣庆 黄丛林 杨清 |
| 作者单位： | 1. 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京,100089;南京农业大学生命科学学院,南京,210095 2. 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京,100089 3. Station de Génétique et Amélionration des plantes,INRA 78026,France 4. 南京农业大学生命科学学院,南京,210095 |
| 基金项目： | 北京市科委科技基金 (编号 :H0 12 0 10 2 40 2 40 113，H0 2 0 82 115 0 13 0 )，科技部中法PRA(编号 :中法PRABT0 2 2 )，国家重大基础研究规划项目 (编号 :2 0 0 3CB114 3 0 0 )资助~~ |
| 摘 要： | 以生长于不同气候条件下的17个拟南芥核心生态型为材料，分析了它们的抗旱转录因子CBF4基因区域的序列多态性。结果表明：拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(Indel)，多态性频率为每35．8bp一个SNP，每143bp一个Indel，基因非编码区的多态性是编码区的4倍；在编码区，SNP的频率为每96．4bp一个SNP，其中发现25av、203av和244av 3个生态型CBF4基因区域1034位(以Gen—Bank登录号AB015478序列第19696位的核苷酸为1)碱基变化：G←→T，引起第205位氨基酸变化：gly←→val。核苷酸多样性统计分析显示，该基因内部大范围内存在连锁不平衡(linkage disequilibrium，LD)，5’端非编码区有一个重组。与拟南芥等的研究结果类似，选择压力对不同的区域作用不同。3’端非编码区核苷酸多样性程度最高，是平衡性选择的结果，编码区核苷酸变化符合中性突变假说，而5’端非编码区是自然选择作用的靶位点。 |
| 关 键 词： | 拟南芥 CBF4基因 核苷酸多样性 |
| 文章编号： | 0379-4172(2004)12-1415-11 |
Nucleotide Polymorphism in the Drought Induced Transcription Factor CBF4 Region of Arabidopsis thaliana and Its Molecular Evolution Analyses |
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| HAO Gang-Ping. Nucleotide Polymorphism in the Drought Induced Transcription Factor CBF4 Region of Arabidopsis thaliana and Its Molecular Evolution Analyses[J]. Journal of Genetics and Genomics, 2004, 31(12): 1415-1425 | |
| Authors: | HAO Gang-Ping |
| Affiliation: | HAO Gang-Ping~ |
| Abstract: | |
| Keywords: | Arabidopsis thaliana CBF4 nucleotide polymorphism |
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