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基于SSR分子标记的沙枣遗传多样性分析和指纹图谱构建
作者姓名:王梓煦  曾郅涵  秦孝天  李子航  童宇航  刘克林  李庆卫
作者单位:北京林业大学 园林学院 林木资源高效生产全国重点实验室, 北京 100083;北京市绿地养护管理事务中心, 北京 102211
基金项目:国家重点研发计划(2020YFD1000500);北京园林绿化增彩延绿科技创新工程(2019-KJC-02-10);北京市园林绿化局《沙枣培育技术规程》制定标准项目(20211245);北京林业大学建设世界一流学科和特色发展引导专项资金项目(2019XKJS0324)
摘    要:为了促进沙枣新品种选育、种质资源鉴定保护和生态经济型沙枣产业综合发展,对沙枣(Elaeagnus angustifolia)种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,挖掘沙枣种质来源和遗传背景。本研究采用多态性好、条带清晰、重复性好的11对引物,利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分子标记技术,对甘肃省和北京市来源的150份沙枣材料的遗传多样性进行了研究,基于遗传距离进行非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类分析,基于贝叶斯模型的Structure v2.3.3软件解析150份种质的遗传结构。在遗传多样性分析中,平均等位基因数为(number of alleles,Na)7.636 4,平均有效等位基因数(number of effective alleles,Ne)为2.832 6,平均Shannon信息指数(Shannon genetic diversity index,I)为1.178 1,Nei’s平均基因多样性指数(Nei’s gene diversity index,H)为0.582 1,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.489 9,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.584 0,平均多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.535 4,平均遗传相似性系数(genetic similarity,GS)为0.831 5,表明所研究的沙枣之间具有显著的遗传差异和丰富的遗传多样性。聚类分析将150份材料划分为3个类群,平均遗传距离(genetic distance,GD)为0.422 9,聚类结果和地理来源并不完全一致。Structure群体结构分析将供试材料分为2个种群。利用8对多态信息含量最高的引物,构建了150份沙枣材料的指纹图谱。本研究成功构建了甘肃和北京沙枣种质资源的DNA指纹图谱,阐明了其亲缘关系,为沙枣种质资源鉴定、优异种质筛选、园林应用和分子辅助育种工作提供了理论依据。

关 键 词:沙枣  遗传多样性  简单重复序列分子标记  指纹图谱
收稿时间:2024-04-02
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