高通量测序技术在植物内生菌领域研究中的应用

植物内生菌是一类能够在植物体内度过部分生命周期而不会引起宿主病害的微生物,是种类和功能十分丰富的微生物资源。随着测序技术的进步,在微生物领域中关于植物内生菌的研究愈发深入。Sanger测序的定向验证性以及较低的测序成本使得该测序技术沿用至今,但其测序的通量较低,不适用于更深层次的内生菌基因组研究。本文简要概述了植物内生菌的研究历程,并综述了以高通量为技术特点的下一代测序(next-generation sequencing,NGS)和以单分子实时测序技术(single-molecule real-time,SMRT)为代表的第三代测序技术在植物内生菌研究领域的应用,总结了不同测序技术在实际研究中的优势和局限性,并探讨了如何根据研究需求选择合适的测序技术,希望为研究者进一步发掘植物内生菌的潜在价值提供参考。