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伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用
引用本文:生秀梅,黄新祥,茅凌翔,朱超望,徐顺高,张海方,许化溪,刘秀梅.伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用[J].生物化学与生物物理进展,2009,36(2):206-212.
作者姓名:生秀梅  黄新祥  茅凌翔  朱超望  徐顺高  张海方  许化溪  刘秀梅
作者单位:1. 江苏大学医学技术学院,镇江,212013
2. 中国疾病颅防控制中心营养与食品安全所,北京,100050
基金项目:国家自然科学基金资助项目(3057008)和国家科技支撑计划资助项目(2006BAK02A15).
摘    要:伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4 201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果.通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致.结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持.

关 键 词:伤寒沙门菌  基凶组DNA芯片  基因表达谱
收稿时间:2008/5/21 0:00:00
修稿时间:2008/7/15 0:00:00

Preparation of Salmonella enterica Serovar Typhi Genomic DNA Microarrays for Gene Expression Profiling Analysis
SHENG Xiu-Mei,HUANG Xin-Xiang,MAO Ling-Xiang,ZHU Chao-Wang,XU Shun-Gao,ZHANG Hai-Fang,XU Hua-Xi and LIU Xiu-Mei.Preparation of Salmonella enterica Serovar Typhi Genomic DNA Microarrays for Gene Expression Profiling Analysis[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2009,36(2):206-212.
Authors:SHENG Xiu-Mei  HUANG Xin-Xiang  MAO Ling-Xiang  ZHU Chao-Wang  XU Shun-Gao  ZHANG Hai-Fang  XU Hua-Xi and LIU Xiu-Mei
Institution:School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;National Institute for Nutrition and Food Safety, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100050, China
Abstract:
Keywords:Salmonella enterica serovar Typhi  genomic DNA microarrays  gene expression profile
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