|
|||||
|
|
| 蒙古冰草PLD基因cDNA克隆及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 康虹丽,邬佳宾,韩冰,何江峰. 蒙古冰草PLD基因cDNA克隆及生物信息学分析[J]. 西北植物学报, 2009, 29(11) |
| 作者姓名： | 康虹丽 邬佳宾 韩冰 何江峰 |
| 作者单位： | 1. 内蒙古农业大学,生物工程学院,呼和浩特,010018 2. 水利部牧区水利科学研究所,呼和浩特,010010 3. 山西农业大学,生命科学学院,山西太谷,030801 |
| 基金项目： | 中国科学院"西部之光"人才培养项目 |
| 摘 要： | 以蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)叶片为材料.根据已报道的醉酒毒麦PLD基因片段设计特异引物,通过RT-PCR和RACE技术,获得蒙古冰草PLD基因的全长cDNA(GenBank登录号为EU333811).该基因cDNA全长2 966 bp,包含2 439 bp的完整开放读码框,编码813个氨基酸.BlastP搜索结果显示,该基因推测的氨基酸序列与已克隆的醉酒毒麦、玉米、水稻PLD基因氨基酸序列的一致性为80%～89%.利用生物信息学软件在线分析其序列结构、氨基酸组成及编码氨基酸的性质和结构,结果表明:该基因编码的蛋白为可溶性蛋白,其相对分子量为92 079.2 Da,理论等电点为5.24,无跨膜域、无信号肽;其二级结构主要以无规卷曲为主;三级结构显示紧靠N端处为C2域,在中间和靠近C端处存在PLD的标志序列,即HKD基序.系统进化树显示,蒙古冰草PLD与醉酒毒麦的亲缘关系最近. |
| 关 键 词： | 蒙古冰草 PLD基因 生物信息学 |
cDNA Cloning of PLD Gene from Agropyron mongolicum Keng and Its Bioinformatics Analysis |
|
| KANG Hong-li,WU Jia-bin,HAN Bing,HE Jiang-feng. cDNA Cloning of PLD Gene from Agropyron mongolicum Keng and Its Bioinformatics Analysis[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2009, 29(11) | |
| Authors: | KANG Hong-li WU Jia-bin HAN Bing HE Jiang-feng |
| Affiliation: | KANG Hong-li1,WU Jia-bin2,HAN Bing1*,HE Jiang-feng3 (1 Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010018,China,2 The Research Institute of Water Resource Science of Pasture Areas,Huhhot 010010,3 College of Life Science,Shanxi Agricultural University,Taigu,Shanxi 030801,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | cDNA RACE |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |