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| 微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性 | |
| 引用本文： | 程鹏,杨爱国,吴彪,周丽青,李霞.微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性[J].水生生物学报,2011,35(5):768-775. |
| 作者姓名： | 程鹏 杨爱国 吴彪 周丽青 李霞 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,青岛266071;大连水产学院生命科学与技术学院,大连116023 2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,青岛266071 3. 大连水产学院生命科学与技术学院,大连,116023 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863)资助课题(2006AA10A408); 国家科技支撑计划专题(2006BAD01A00); 黄海所基本科研业务费(2060302/2-TS10)资助 |
| 摘 要： | 实验选取8 个多态性微卫星位点, 用于虾夷扇贝4 个不同壳色全同胞和半同胞家系160 个子代的亲权鉴定。在亲本未知和一亲本已知的情况下, 8 个微卫星位点累积排除概率分别为0.823 和0.961。鉴于亲权分析时子代的亲本在已知和未知情况下位点的累积排除概率不同, 实验采用了两种方法用于家系的亲权鉴定。方法1: 当子代的父母本情况未知时, 根据子代基因型数据, 通过CERVUS 2.0 软件计算子代所对应的候选亲本的LOD 值, 直接将候选亲本中具有最大的两个LOD 值的亲本确定为子代的父母本; 方法2: 在子代的亲本未知情况下, 视具有最大LOD 值的候选亲本为子代的第一候选亲本, 然后将该亲本视为已知, 通过CERVUS 2.0 软件重新计算每个侯选亲本的LOD 值, 再从中选择具有最大LOD 值的候选亲本作为该子代的第二候选亲本。结果表明, 采用方法2 得到的家系亲权鉴定成功率达到95%以上, 确定了微卫星标记在虾夷扇贝家系鉴定中的可行性。所检测的微卫星位点在子代中出现无效等位基因现象, 而无效等位基因存在会引起子代与亲本的错配。实验在家系鉴定时采用了无效等位基因存在(情况1)和缺失(情况2)两种子代基因型文件进行分析, 不同情况下同一方法家系鉴定成功率相差无几。这表明了基于多个微卫星位点计算候选亲本LOD 值大小寻找子代真实父母本可以降低由无效等位基因引起的错配的几率。研究表明了微卫星标记适合于不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定工作。
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| 关 键 词： | 微卫星 壳色 虾夷扇贝 亲权鉴定 等位基因 |
THE APPLICABILITY ANALYSIS ON MICROSATELLITE MARKERS FOR PARENTAGE DETERMINATION OF DIFFERENT SHELL COLOR LINES OF JAPANESE SCALLOP PATINOPECTEN YESSOENSIS |
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| CHENG Peng,YANG Ai Guo,WU Biao,ZHOU Li Qing,LI Xia.THE APPLICABILITY ANALYSIS ON MICROSATELLITE MARKERS FOR PARENTAGE DETERMINATION OF DIFFERENT SHELL COLOR LINES OF JAPANESE SCALLOP PATINOPECTEN YESSOENSIS[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2011,35(5):768-775. | |
| Authors: | CHENG Peng YANG Ai Guo WU Biao ZHOU Li Qing LI Xia |
| Institution: | CHENG Peng1,2,YANG Ai Guo1,WU Biao1,ZHOU Li Qing1 and LI Xia2(1.Key Laboratory for Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao 266071,China,2.School of Life Science and Technology,Dalian Fisheries University,Dalian 116023,China) |
| Abstract: | 8 polymorphic microsatellite loci were selected for parentage determination on different shell color lines of Patinopecten yessoensis.3 full-sib families and 1 half-sib family of P.yessoensis,each with 40 individuals,their parents were subjected to microsatellite analysis.The value of the total exclusionary power of 8 loci was 0.823 with the parents were unknown;when a typed single parent was known,the value of the total exclusionary power of 8 loci was 0.961.Two methods were used to analyze the parentage d... |
| Keywords: | Microsatellite Shell color Patinopecten yessoensis Parentage analysis Allele |
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