黑曲霉脯氨酸蛋白内肽酶基因的克隆与序列分析

以黑曲霉(A.niger)TCCC41013的总RNA作为模板,通过RT-PCR扩增出含自身信号肽的脯氨酸蛋白内肽酶基因,将其插入pUCm-T载体上,经PCR和酶切鉴定后进行测序并分析.所克隆的PEP基因全长为1 581bp,编码526个氨基酸残基,成熟肽为504个氨基酸残基.与GeneBank中已报道的A.niger CBS513.88的PEP序列同源性最高,达到99.75%.脯氨酸蛋白内肽酶是一种新型的丝氨酸蛋白酶,黑曲霉PEP与已克隆的其他菌种的PEP同源性不高.     

狂犬病病毒CVS株核蛋白基因的原核表达、纯化及鉴定

用KT-PCR技术对狂犬病病毒(RV)CVS株核蛋白(N)基因进行扩增,经克隆与序列分析,该基因编码450个氨基酸残基.将目的基因克隆到原核表达载体pET28a( )中,构建了重组质粒pET-N,将其转化表达菌BL21(DE3),于37℃1.0mmol/L IPTG条件下诱导表达.大肠杆菌菌体裂解产物经SDS-PAGE电泳分析,在分子量约为54kD处出现一新蛋白带,和预期的目的蛋白的分子量相符.质谱鉴定的结果表明成功表达了RV N蛋白,为狂犬病的进一步研究奠定了基础.     

中国吉丁虫新纪录种简记

近年来。笔在研究各地送鉴的大呈吉丁虫标本过程中。鉴定出一批中国新纪录种，今集中加以报道．并分别作简述如下。     

基于指标自动筛选的新疆开孔河流域生态健康评价

生态健康评价对了解区域生态健康状况和促进区域可持续发展具有重要意义,如何自动筛选出能反映生态系统特性的重要指标,是生态健康定量评估的关键问题。基于压力-状态-响应(PSR,Press-State-Response)框架和生态等级网络框架(EHN,Ecological Hierarchy Network),通过文献调研和因果分析建立要素层与指标层之间的交叉联系,构建了生态健康评价"网状"指标体系;在保证指标体系完备性基础上,通过结合主成分分析和熵权法的候选指标权重的客观计算,基于目标优化理论构建了评价指标的自动筛选模型,并基于中选指标计算了新疆开孔河流域2001—2017年生态健康指数(EHCI,Ecological Health Comprehensive Indexes),分析其空间分异和时间变化特征。结果表明:利用所建立的评价指标自动筛选模型,开孔河流域生态健康评价指标由31个候选指标自动筛选出了17个中选指标,用54.8%的指标表达了85.98%的信息,中选的17个指标在干旱/半干旱区域有关文献中应用较多,使用频次比例都在20%以上,其中归一化植被指数(NDVI,Normalized Difference Vegetation Index)、年降水量和植被覆盖度(FVC,Fractional Vegetation Coverage)3个指标的使用频次百分比均超过了50%,说明指标自动筛选模型的合理性;开孔河流域空间分布差异显著,总体上西北高、东南低,东南部和中部绿洲区外围生态健康状况较差,西北部河谷地带和中部两大绿洲区生态健康状况较好;17年来,流域生态质量整体趋于改善,显著改善区域占10.26%,远高于显著退化的1.61%,显著改善区域以孔雀河绿洲最为明显。开孔河流域生态健康的总体好转趋势说明区域生态综合治理取得一定成效。     

野放前候选扬子鳄泄殖腔的细菌鉴定(英文）

扬子鳄(Alligator sinensis)是中国濒危的物种，野生鳄种群已濒临灭绝。通过放归工程，将挑选饲养鳄放养到野外去扩大野生种群。本文的研究目的是通过检测扬子鳄的健康状况为扬子鳄的筛选提供依据。从25条准备进行野放的扬子鳄泄殖腔中筛选出13种形态不同的菌株。应用细菌学和分子生物学方法，鉴定它们分别属于6个属的8个种和一个未分类的菌；从扬子鳄生活的水体中筛选出8种形态不同的菌株，鉴定它们分别属于1个属的4个种。经分析，除了未分类的菌之外，从扬子鳄泄殖腔中分离得到的菌株都是非致病性的且不同于扬子鳄生活水体中分离的菌株，因此可以认为这些扬子鳄是健康的，可以野放。由于从标记为AS12的扬子鳄体内分离到一个分类地位尚未确定的菌，对它的生理生化特征进行了检测，但这种菌的致病性方面特征尚不清楚，建议不考虑野放标记为AS12的扬子鳄个体。     

兰州唐古特白刺根际微生物分离鉴定

【目的】从兰州唐古特白刺根际分离得到对植物有潜在促生效果的功能微生物，为研发相关菌种制剂的研究奠定基础。【方法】通过平板划线法从其根际分离纯化出6株细菌，并对菌株进行形态特征观察、革兰氏染色等一系列生理生化试验。用藜麦检测各菌株的促生功能，并对具有优良促生作用的1个菌株16S rRNA基因进行分子鉴定及基因草图绘制。【结果】根据生化鉴定结果，6株细菌分别属于不动杆菌属(Acinetobacter)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和假单胞菌属(Pseudomonas)。其中，16S rRNA基因鉴定BC4属于肠杆菌属(Enterobacter)，具有较好的促生效果。【结论】BC4具有较好的促生效果，为兰州唐古特白刺菌种资源的开发和利用提供了一定的理论依据。     

亚稀褶黑菇和稀褶黑菇的ITS序列分析

对亚稀褶黑菇和稀褶黑菇的ITS全序列进行了测定和比较，首次报道了亚稀褶黑菇的ITS1和5.8S区域。在ITS区域中，不同采集地的亚稀褶黑菇与稀褶黑菇的5.8S rDNA具有100%的同源性，而两侧ITS之间表现出种内和种间的多态性，种内的差异均不超过5%，种间的差异达10%左右。ITS序列分析方法可以作为两者的鉴定方法。     

含奥氏酮嗜盐紫色硫细菌的分离鉴定及系统发育分析

[目的]为挖掘我国紫色硫细菌物种和光合蛋白基因资源.[方法]采用Pfennig紫色硫细菌无机选择性培养基和琼脂稀释法.[结果]从青岛东风盐场分离获得一株含奥氏酮、耐高浓度硫化物、嗜盐耐碱紫色硫细菌菌株283-1.该菌株能氧化硫化物产生硫粒储存在细胞内、嗜盐、细胞含有奥氏酮类胡萝卜素、细菌叶绿素a强吸收峰位于830 nm处、运动、不产生气囊,表明属于Marichromatium属.16S rDNA序列同源性比较和系统发育分析也表明这一点.但该菌株能在1%～15%NaCl、7.5 mmol/L 高浓度硫化物、45℃、5000lux、pH9.0条件下生长良好,能很好的光同化C3和C4有机酸和葡萄糖酸钠等特性,与Marichromatium属4个种有明显不同.[结论]菌株283-1是Marichromatium属一个新分离物,编号 Marichromatium sp.283-1.     

ERIC-PCR对鸡舍大肠杆菌气溶胶向舍外环境传播的鉴定

为了研究鸡舍环境中大肠杆菌气溶胶向舍外环境的传播，本实验采用Andersen-6级空气微生物样品收集器和RCS（reuter centrifugal sampler）-离心式采样器分别在5个鸡场舍内空气、合外上风向10，50m和下风向10，50，100，200，400m不同距离收集气载大肠杆菌，计算每一个采样点的大肠杆菌的浓度（CFU·m^-3空气）；并采集鸡的粪便，分离大肠杆菌．利用肠杆菌基因间重复一致序列的聚合酶链式反应（enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction．ERIC-PCR）鉴定技术，扩增不同测量点收集的大肠杆菌的DNA条带，形成聚类图谱．通过每一个采样点分离的大肠杆菌遗传相似性分析以及大肠杆菌浓度变化，确认动物舍微生物气溶胶向舍外环境的传播模式．结果显示，5个鸡场舍内空气中大肠杆菌的浓度（中间值）为9-63 CFU·m^-3,远远高于舍外上风和舍外下风处的大肠杆菌浓度（P〈0．05），但是舍外下风不同距离间的大肠杆菌浓度差异并不显著（P〉0．05）．ERIC-PCR结果表明，从鸡的粪便中分离到的大肠杆菌与从舍内空气中分离到的部分大肠杆菌（34．1％）相似性可达100％，从鸡场舍外下风方向（10，50，100，200m）分离到的多数大肠杆菌（54．5％）与舍内空气或粪便中分离的大肠杆菌相似性可达100％．而从鸡舍上风分离到的大肠杆菌与舍内空气或粪便中分离的大肠杆菌相似性仅在73％～92％之间．结果表明：从上风分离到的多数大肠杆菌并非来源于鸡的粪便或者舍内空气，而很多从舍内空气和舍外下风方向分离到的大肠杆菌来源于鸡的粪便，说明源于鸡舍的微生物气溶胶能够通过舍内外气体交换传播到舍外，依气象条件传播到舍外不同的距离，造成周边环境的生物污染以及病原微生物的扩散．对动物舍环境微生物气溶胶的发生与传播规律的研究，具