科学出版社生命科学编辑部新书推介（2006-1月）

《微生物基因组》；《混沌生物学》（生命科学交叉系列）；《数字创世纪：人工生命的新科学》（生命科学交叉系列）；《脑与非线性动力学》（生命科学交叉系列）；《中国遗传伦理的争鸣与探索》（生命科学交叉系列）；     

人工生命：一场人类发明自身的革命

克雷格·文特尔的研究思路和想法非常具有前瞻性,开始时往往使人们觉得匪夷所思、闻所未闻。1990年到2000年,文特尔研究“人类基因组图谱”用了十年的时间。从2002年开始,文特尔的思路开始集中于“人工生命”——他提出了“人工生命三步计划”。     

“人造生命”指日可待了吗？

胚胎干细胞的发现使得克隆技术的伦理问题迎刃而解,我们正处于“干细胞革命时代的开端”,这是否就意味着未来等待我们的将是是“人工生命的大发展时期”呢？     

采用人工生命方法模拟七星瓢虫捕食行为进化

自从 2 0世纪 70年代Ｂｕｒｋｓ[1] 提出人工生命的概念后 ,人工生命作为一个全新的研究领域 ,以其特有的优势在近些年来得到迅猛地发展。人工生命的基本思想是去构造某种人工系统以达到对生物的生长、发育、遗传、变异、生殖、进化、学习等生命过程重要特征的模拟 ,从而认清这些生命现象的本质。人工生命有广泛的应用 ,它所使用的方法也是多样的。粗略地说 ,可分为湿件 (Ｗｅｔｗａｒｅ ,意为采用化学方法模拟 )、硬件 (Ｈａｒｄｗａｒｅ ,意为用机器人模拟 )和软件 (Ｓｏｆｔｗａｒｅ ,意为用程序模拟 )。本文集中在采用软件方法进行行为…     

“电脑生命”是“生命”吗？

「电脑生命」是「生命」吗？＠周俊「电脑生命」是「生命」吗周俊今天,愈来愈多的自然科学家已经开始意识到,揭示生命起源奥秘的最有效的方法就是重演生命诞生的过程,这就意味着要重新创造出生命。可是,按照奥巴林、米勒等人所标定的实验方向采用化学合成的传统方法,要产生...     

虚拟物种的基本原理及其在物种分布模型评估中的应用

物种分布模型是建立在物种出现或缺失数据的基础上,但可获得的真实分布数据存在着各种各样的缺点(如:物种识别错误、坐标错误、抽样偏差、数据缺失等),影响着物种分布模型的预测性能、稳定性及应用,因此使用物种真实分布数据评估物种分布模型将带来很大的不确定性。为避免这种不确定性,越来越多的研究使用虚拟物种来评价物种分布模型的性能,评估新方法的优劣。虚拟物种是一种建立在真实(或虚拟)地理信息系统下人工生命,是简化和抽象的物种,它通过模拟物种对环境变量的响应关系,评估物种在不同环境变量下的出现概率,人为地给出虚拟的物种分布数据。虚拟物种具有数据容易获得、数据质量可控、避免过度模拟等优势,目前它被广泛用于评估物种特性、抽样偏差、地理信息、出现/缺失标准等对物种分布模型性能的影响。虚拟物种是大尺度研究中不可或缺的重要工具,有利于解决真实数据未能解决的科学问题。常用的构成算法有求和法、求积法和综合法,但这些方法可能存在补偿效应,扩大了物种的分布范围。考虑到虚拟物种的不足,提出了未来虚拟物种可能的发展方向(避免过度脱离真实,完善虚拟物种的构成算法,构建虚拟的模式生物、群落及生态系统等)。为帮助研究者快速构建虚拟物种,基于R环境开发了一个虚拟物种构成软件包(SDMvspecies)。虚拟物种可以与真实物种相结合,通过改进模型的构成方法,有利于解决一些真实数据未能解决的问题;虚拟物种的应用也将导致一些新理论的产生,有利于更好地理解生态学原理。     

虚拟细胞

虚拟细胞是20世纪末在国外刚刚兴起的一种细胞生物学研究方法,主要是通过计算机建立人工细胞模型,模拟细胞内外环境,从而进行生物学的研究和探索。虚拟细胞包含了多门学科前沿的研究成果,具有十分重要的意义。现从其发展历程、应用及其对生物学工作者的关系等方面进行综述。