不同温度条件下鲁氏耶尔森氏菌的链特异性转录组分析

为鉴定鱼源鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri) SC09菌株水生环境中不同温度的转录组水平上的差异, 研究采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对菌体生理温度(28℃)和实验培养温度(37℃)下进行链特异性测序, 原始数据质控后, 筛选得到差异表达基因, 通过KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达基因进行富集分析, 并利用Rockhopper软件筛选出的重要原核生物基因簇进行验证。结果显示, 共筛选获得173个显著差异表达基因(P<0.05), 其中包括58个上调基因, 主要富集到一些特殊的碳水化合物代谢相关的通路中; 以及115个下调基因, 主要富集到双组份信号系统中与三羧酸循环相关的代谢通路上, 同时部分基因富集到编码鞭毛素相关的基因簇中。结果表明, 相对于37℃的实验室培养温度, 在水生环境的生理温度条件下(28℃) SC09菌株拥有较高的运动性和较强的葡萄糖代谢, 但相对的SC09菌株代谢一些特殊糖类的能力减弱。     

云斑(鱼回)、泥鳅和瓦氏黄颡鱼的含肉率及营养价值比较研究

研究了3种人工养殖的小型经济鱼类云斑(鱼回)(Ictalurus ncbulosus)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)和瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco,Richardson)含肉率和肌肉的熟肉率、生化成分、氨基酸和脂肪酸的种类组成,并对其营养价值进行评定.结果表明:云斑(鱼回)和瓦氏黄颡鱼含肉率分别为(74.48±2.01)%和(73.63±3.27)%,二者间无显著性差异,显著高于泥鳅(65.95±1.27)%.泥鳅熟肉率最高为(69.36±2.35)%.泥鳅肌肉中蛋白质含量为(16.24±0.56)%,明显高于云斑(鱼回)的(15.34±0.44)%和瓦氏黄颡鱼的(14.45±0.24)%.瓦氏黄颡鱼肌肉中脂肪含量最高为(2.4±0.17)%,与云斑(鱼回)(1.22±0.33)%和泥鳅(1.26±0.60)%有显著性差异.云斑(鱼回)、泥鳅和瓦氏黄颡鱼肌肉中,含人体必需氨基酸占总氨基酸的比例为(40.06±0.63)%、(39.79±0.57)%和(40.36±0.52)%.3种鱼的第一限制性氨基酸均为缬氨酸,F值均在4.90-5.06之间.4种鲜味氨基酸总含量均高于29%,泥鳅和瓦氏黄颡鱼鲜味氨基酸大多明显高于云斑(鱼回).3种鱼肌肉中不饱和脂肪酸含量明显高于饱和脂肪酸,泥鳅和瓦氏黄颡鱼高于云斑(鱼回).云斑(鱼回)肌肉中廿碳五烯酸(C20:5)为(2.52±0.30)%,显著高于泥鳅(0.16±0.05)%和瓦氏黄颡鱼(0.12±0.04)%(P<0.05),廿二碳六烯酸(C22:6)含量泥鳅最高为(4.62±0.30)%,其次为瓦氏黄颡鱼(2.86±0.32)%,云斑(鱼回)最低为(1.84±0.27)%,三者间均有显著性差异.结果表明,泥鳅和瓦氏黄颡鱼具有独特风味,3种小型经济鱼类均为有较高营养价值的人类食品.