江苏部分地区猪源结肠弯曲菌耐药性分析及多位点序列分型

【背景】弯曲菌(Campylobacter)是重要的人畜共患肠道病原菌,可通过食物链传播,引起人类腹泻性肠炎。【目的】了解猪源弯曲菌耐药特征和分子遗传特征,对江苏省10个规模化猪场进行弯曲菌分离和耐药性检测,并研究分离株的分子分型。【方法】采用琼脂平板稀释法进行最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)测定,PCR方法扩增耐药基因,以弯曲菌7个管家基因(aspA、glnA、gltA、glyA、pgm、tkt和uncA)为目的基因进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)研究。【结果】100份样品共分离出结肠弯曲菌22株,分离率为22%,弯曲菌检出情况与养殖规模和日龄无关(P>0.05)。耐药性试验结果显示,20株分离株为多重耐药菌株(81.82%,20/22),猪源结肠弯曲菌分离株对10种抗生素耐药程度不一,分别为：庆大霉素36.36%,链霉素50%,克林霉素27.27%,氯霉素13.64%,四环素40.91%,环丙沙星18.18%,萘啶酸63.63%,泰利霉素59.09%,红霉素100%,阿奇霉素81.82%;共检出了4种耐药基因[cfr、adE-Sat4-aphA、ermB和Tet(O)],检出率分别为4.5%、59.1%、9.1%和100%;多位点序列分型结果显示共获得11个ST型,主要流行CC-828克隆系(100%);进化树结果显示,所有分离株聚集归为2个大群,分别为2个分支和9个分支。χ2检验和Logistic回归模型表明共有3个序列型(sequence type,ST)与其相对应的抗菌药物有相关性。【结论】猪源结肠弯曲菌对大环内酯类抗生素具有较高的耐药性,Tet(O)基因检出率最高,分离株的序列型呈多样性。     

一株同时携带optrA和cfrC基因的猪源多重耐药结肠弯曲菌的全基因组测序

【背景】弯曲菌(Campylobacter)是一种世界范围内能引起胃肠炎的最常见食源性病原菌,对临床上重要的抗菌药物耐药越来越严重,对食品安全和公共健康造成重大威胁。【目的】研究一株同时携带optr A和cfr C基因的猪源结肠弯曲菌(Campylobactercoli)耐药表型和耐药基因,同时对该菌全基因组特征、毒力基因分布情况以及optr A和cfr C基因环境进行分析。【方法】采用琼脂平板稀释法进行最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC)测定,并且对该菌进行全基因组测序。【结果】该菌株对四环素、克林霉素、阿奇霉素、氟苯尼考和利奈唑胺呈现高度耐药,对环丙沙星和庆大霉素敏感。全基因组测序得到一条大小为1 436 486 bp的环状DNA (GC含量为31.63%),携带四大类抗生素中共计12种耐药基因,均定位于染色体上,其中氨基糖苷类耐药基因数量最多。此外,携带包含黏附、侵袭和移动等相关毒力基因83个,其中与移动相关的毒力基因数量最多。对4个基因岛分析发现,基因岛GIs002和GIs003中含有耐药基因序列,cfr C位于基因岛GIs...     

利用微卫星标记分析我国13个地方灰羽鹅品种的遗传多样性

我国地方鹅品种具有很多优良性状,但长期以来由于没有形成科学的选育制度和培育方法,品种的遗传多样性没有得到完整保存。为了深入了解我国地方鹅品种的遗传结构,使之得到更好的保护和利用,作者选用31个多态性较高的微卫星标记(其中19个是首次用磁珠富集法从AFLP片段中分离),检测了我国13个地方灰羽鹅(An-sercygnnoides)品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:13个地方灰羽鹅品种中,平均多态信息含量为0.323–0.398,平均杂合度为0.4985–0.6727,各品种的杂合度都较高,最高的是狮头鹅(0.6727),最低的是雁鹅(0.4985)。用UPGMA法进行聚类分析的结果显示,13个品种被聚为4类:丰城灰鹅、武冈铜鹅、兴国灰鹅、狮头鹅、乌棕鹅、阳江鹅、马冈鹅、钢鹅、雁鹅聚为第1类;伊犁鹅自聚为第2类;长乐鹅、右江鹅聚为第3类;永康灰鹅自聚为第4类。本研究为鹅遗传育种提供了参考资料。     

我国地方鸡品种保种群微卫星多态性分析与分子标记档案的建立

利用20个微卫星标记对国家家禽品种资源基因库中保存的11个地方鸡品种保种群进行了遗传检测,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离,并用类平均法进行聚类分析。研究结果表明：20个微卫星标记在11个地方鸡品种保种群共检测到176个等位基因,平均为8.8个,基因频率分布在0.013～0.838之间。检测到等位基因中,有45个等位基因为11个地方鸡品种所共有;11个地方鸡品种平均杂合度在0.6800～0.7432之间。其中藏鸡最高,为0.7432;狼山鸡最低,为0.6800;平均多态信息含量在0.6329～0.7023之间,均大于0.5,表现为高度多态性;11 个鸡品种聚为4类。丝羽乌骨鸡、茶花鸡、仙居鸡、藏鸡、萧山鸡聚为一类,鹿苑鸡、狼山鸡聚为一类,固始鸡、北京油鸡、大骨鸡聚为一类,河南斗鸡单独聚为一类;通过利用20个微卫星基因座检测不同世代群体中等位基因及其频率、群体基因平均杂合度和多态信息含量,建立地方鸡品种保种群微卫星标记档案,并分析世代间的差异,预期可以达到监测保种效果的目的。     

不同饲养方式对各产蛋阶段鸡蛋品质的影响

目的：比较不同饲养方式对鸡蛋品质的影响,为蛋鸡产业化生产提供指导。方法：以如皋黄鸡为试验素材,采用笼养和平养两种饲养方式,测定不同产蛋阶段常规蛋品质、营养成分和矿物元素含量。结果：产蛋初期,平养条件下蛋黄色泽、脂肪和胆固醇含量极显著高于笼养（P＜0-01）,铜和铁含量显著低于笼养（P＜0-05）。产蛋中期,平养条件下蛋壳强度、蛋黄重量、蛋黄比率、蛋黄蛋白比均显著低于笼养（P＜0-05）;哈氏单位以及蛋白质、维生素E和氨基酸含量均显著高于笼养（P＜0-05）;蛋黄色泽、维生素A和胆固醇含量均极显著高于笼养（P＜0-01）,锰含量极显著低于笼养（P＜0-01）。产蛋后期,平养条件下胆固醇含量极显著高于笼养（P＜0-01）;蛋白质、维生素A和铜含量显著高于笼养（P＜0-05）;锰含量极显著低于笼养（P＜0-01）;硒含量显著低于笼养（P＜0-05）。结论：不同产蛋阶段,饲养方式对鸡蛋品质均有一定的影响。     

青壳鸡蛋与褐壳鸡蛋品质及营养成分比较分析

为了比较青壳鸡蛋和褐壳鸡蛋品质的差异,以苏禽青壳蛋鸡和海兰褐壳蛋鸡2个鸡种为试验素材,采用笼养饲养方式,测定苏禽青壳蛋鸡和海兰褐壳蛋鸡鸡蛋的常规蛋品质和营养成分含量。结果表明：在常规蛋品质方面,苏禽青壳蛋鸡鸡蛋的哈氏单位和蛋黄色泽极显著高于海兰褐蛋鸡鸡蛋（P＜0.01）,蛋黄比率显著高于海兰褐蛋鸡鸡蛋（P＜0.05）,蛋重极显著小于海兰褐蛋鸡鸡蛋（P＜0.01）,蛋形指数、蛋壳厚度和蛋壳强度差异不显著。在营养成分方面,苏禽青壳蛋鸡鸡蛋的干物质、脂肪、胆固醇和卵磷脂含量均极显著高于海兰褐蛋鸡鸡蛋（P＜0.01）,蛋白质和氨基酸含量差异不显著。钙、镁、铜含量两者差异不显著,但苏禽青壳蛋鸡鸡蛋的铁、锌、锰、硒、磷含量均极显著高于海兰褐蛋鸡鸡蛋（P＜0.01）,可见鸡种对鸡蛋常规品质和营养成分均具有一定的影响。