表达谱基因芯片的可靠性验证分析

cDNA芯片是一项新兴的能评估检测全范围mRNA表达水平变化的技术。通过同种组织RNA自身比较实验及不同组织RNA的差异分析实验对cDNA芯片实验的重复性进行检验,利用相关系数(correlation coefficient,R)、变异系数(coefficient of variation,CV)和假阳性率(false positiver ate,FPR)分析eDNA芯片数据的可靠程度,对cDNA芯片实验数据作了整体的评估。结果证实,该芯片系统得到的cDNA表达谱数据相关系数一般大于0．9,平均变异系数15％左右,假阳性率控制在3％以内。还提出一致率(consistence rate,CR)的概念,作为衡量cDNA芯片系统重复性的新参数,同时阐述了该参数优于目前常用的相关系数及变异系数的特点。另外,通过比较芯片制备中点样浓度、mRNA和总RNA以及不同批次芯片和不同标记过程对实验的影响,来分析芯片数据的系统误差来源。并提出重复两次实验,可以克服绝大部分实验系统引入的假阳性。     

一种用于基因芯片可靠的RNA线性扩增技术

基因芯片是大规模表达谱分析的有力工具 ,有助于阐明疾病发生的分子机制及发现新的诊治靶标。但常规方法需要大量RNA ,每张芯片需要 5 0～ 2 0 0 μg总RNA ,2～ 5 μgmRNA。许多珍贵难得样本都不能满足这一要求 ,成为限制芯片广泛应用的瓶颈。结合模板转移效应 ,优化了基于T7的RNA线性扩增技术 ,可从 3μg以下总RNA得到足量的反义RNA ,克服了这一难题。同一RNA样本的自身比较试验结果显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片假阳性率相似。同一对RNA样本的表达谱分析也显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片无明显差异。     

光释光单片技术及其在澳大利亚旧石器遗址上的应用

近几年光释光测年技术有了很大的发展,主要体现在单片技术和单颗粒技术的建立与应用上。新技术降低了样品的用量,提高了测量精确度,并使得准确测定不均匀晒退沉积物的年龄成为可能。通过澳大利亚旧石器遗址多种释光技术测年结果的对比,可以看到热释光法和光释光法对晒退彻底的沉积物同样可行,而对不均匀晒退的沉积物,只有光释光的单片技术才能获得可靠的年龄。由于我国旧石器遗址中大多缺乏彻底晒退的沉积物,单片技术可能在建立这些遗址的年代框架方面起到重要作用。     

一种改良的质粒DNA小量提取法

对碱裂质粒小量法进行了改进,并且在提取过程中增加了ＬｉＣｌ处理。实验证明这种方法结果稳定,提取的质粒ＤＮＡ产量高、质量好,符合大多数分子生物学常规实验的要求。     

信使核糖核蛋白通过核孔的运输

信使核糖核蛋白通过核孔的运输韩志勇朱睦元（杭州大学生命科学学院,杭州３１００１２）关键词信使核糖核蛋白（ｍＲＮＰ）核孔复合体巴尔尼氏环图１ＢＲｍＲＮＰ颗粒的装配和运输（上）包含五个外显子的ＢＲ基因;（中）ＢＲ颗粒在基因水平的装配（左）、展开和穿过ＮＰ...     

大麦黄矮病毒分子生物学的研究进展

大麦黄矮病毒（ＢａｒｌｅｙＹｅｌｏｗＤｗａｒｆＶｉｒｕｓ,ＢＹＤＶ）是黄矮病毒组（Ｌｕｔｅｏｖｉｒｕｓ）中的一员。它只能通过蚜虫传播,广泛流行于北美、欧洲、东亚的大麦产区。大麦黄矮病主要引起大麦矮化,抑制分蘖,减少穗数,造成不孕以至不能结实。除大麦外...