人乳头状瘤病毒DNA检测在宫颈病变筛查中的应用研究

目的：探讨高危型人乳头状瘤病毒（HR-HPV）DNA检测方法在宫颈病变筛查中的应用意义。方法：580例妇女同时进行薄层液基细胞学（TCT）、第2代杂交捕获法（HC Ⅱ）和阴道镜下宫颈组织活检,并以病理组织学检查结果作为确诊标准进行对比分析。结果：①580例受检者中病理诊断为炎症207例（35.69%）,CIN Ⅰ 224例（38.62%）,CIN Ⅱ 96例（16.55%）,CIN Ⅲ 38例（6.55%）,浸润癌15例（2.58%）;②TCT检测异常者中炎症52例（25.12%）,CIN Ⅰ 177例（79.02%）,CIN Ⅱ 85例（88.54%）,CIN Ⅲ36例（94.74%）,浸润癌15例（100%）,其中CIN Ⅱ和CIN Ⅲ组间差异无统计学意义（P〉0.05）,但显著高于炎症组和CIN Ⅰ组,低于湿润癌组（P〈0.01或0.05）;③HPV DNA检测阳性者中炎症66例（31.88%）,CIN Ⅰ 152例（67.86%）,CIN Ⅱ 83例（86.46%）,CINIII 35例（92.11%）,浸润癌组15例（100%）,除CIN Ⅱ和CIN Ⅲ组间差异无显著性外（P〉0.05）,其余各组间差异均有统计学意义（P〈0.05或0.01）,且HPV-DNA检测阳性组CIN和浸润癌发病率明显高于阴性组（P〈0.01）;④30岁以下高危险型HPV感染率（65.53%）显著高于30岁以上34.47%感染率（P〈0.01）;⑤联合应用TCT、HPV-DNA检测诊断宫颈癌及癌前病变的敏感度和特异度分别为96.14%和69.28%,高于TCT或HPV-DNA的单独检测。结论：宫颈高危险型HPV感染是CIN及宫颈癌的主要发病因素,并与病变严重程度密切相关,而HPV-DNA和TCT联合应用可提高宫颈癌及癌前病变的检出率。     

基于高覆盖(磷酸化)蛋白质组对人胚胎干细胞干性维持调控网络的解析

目的:对人胚胎干细胞H9的(磷酸化)蛋白质组进行鉴定和深入分析,探讨维持人胚胎干细胞干性的核心调控网络。方法:利用新近发表的TAFT磷酸化肽段富集策略和高精度质谱鉴定技术,采用无标定量方法对H9细胞(磷酸化)蛋白进行定量分析;结合MOTIFX、iGPS、IPA等多种生物信息学分析软件,分析H9细胞的磷酸化基序-激酶、转录因子-靶基因调控网络。结果:获得了目前高度覆盖的H9细胞(磷酸化)蛋白质组数据集,鉴定到8674种蛋白质,其中3898种能够发生磷酸化修饰,包括13 676条磷酸化肽段,高可信度(class 1)磷酸化位点有11 870种。与已有的H9细胞磷酸化蛋白质组数据相比,其中2247种磷酸化蛋白质和10 025种磷酸化位点是本研究新鉴定到的。基于基序和激酶预测分析,推导出与干性维持相关的已知转录调节因子的新的磷酸化修饰基序以及调控其发生磷酸化的激酶。结合多能性转录因子对靶基因的调控信息,构建了多能性调控分子磷酸化修饰及其转录调控的核心网络。此外,还对特定位点的磷酸化修饰水平及其对应蛋白的总体丰度水平进行了比较及功能分析。基于各自的百分位数,比较磷酸化修饰水平与其对应蛋白的总体丰度,发现具有高丰度但低磷酸化修饰水平的蛋白倾向于参与物质转换或物质运输等生物过程,而低丰度但高磷酸化水平的蛋白质倾向于参与信息转导或调控过程。结论:提供了人胚胎干细胞H9高覆盖的(磷酸化)蛋白质组数据,这些数据有助于深入了解蛋白质磷酸化修饰在胚胎干细胞干性维持中所发挥的重要作用,为胚胎干细胞基础和应用研究提供了宝贵的数据资源。     

兰科植物microRNA的研究进展

microRNA (miRNA)是一类广泛存在的非编码小分子RNA,在植物的生长发育和应激反应等过程中起到重要的调控作用.本文从miRNA在植物中的作用机制出发,对近10年来兰科植物各属miRNA的鉴定、几类miRNA的具体功能及miRNA的其他相关技术研究进行综述,以期为兰科植物小分子RNA的功能作用及调控网络解析提...     

人乳头状瘤病毒DNA 检测在宫颈病变筛查中的应用研究

目的:探讨高危型人乳头状瘤病毒(HR-HPV)DNA检测方法在宫颈病变筛查中的应用意义。方法:580例妇女同时进行薄层液基细胞学(TCT)、第2代杂交捕获法(HC Ⅱ)和阴道镜下宫颈组织活检,并以病理组织学检查结果作为确诊标准进行对比分析。结果:①580例受检者中病理诊断为炎症207例(35.69%),CIN Ⅰ 224例(38.62%),CIN Ⅱ 96例(16.55%),CIN Ⅲ 38例(6.55%),浸润癌15例(2.58%);②TCT检测异常者中炎症52例(25.12%),CIN Ⅰ 177例(79.02%),CIN Ⅱ 85例(88.54%),CIN Ⅲ36例(94.74%),浸润癌15例(100%),其中CIN Ⅱ和CIN Ⅲ组间差异无统计学意义(P>0.05),但显著高于炎症组和CIN Ⅰ组,低于湿润癌组(P<0.01或0.05);③HPV DNA检测阳性者中炎症66例(31.88%),CIN Ⅰ 152例(67.86%),CIN Ⅱ 83例(86.46%),CINIII 35例(92.11%),浸润癌组15例(100%),除CIN Ⅱ和CIN Ⅲ组间差异无显著性外(P>0.05),其余各组间差异均有统计学意义(P<0.05或0.01),且HPV-DNA检测阳性组CIN和浸润癌发病率明显高于阴性组(P<0.01);④30岁以下高危险型HPV感染率(65.53%)显著高于30岁以上34.47%感染率(P<0.01);⑤联合应用TCT、HPV-DNA检测诊断宫颈癌及癌前病变的敏感度和特异度分别为96.14%和69.28%,高于TCT或HPV-DNA的单独检测。结论:宫颈高危险型HPV感染是CIN及宫颈癌的主要发病因素,并与病变严重程度密切相关,而HPV-DNA和TCT联合应用可提高宫颈癌及癌前病变的检出率。     

一氧化氮诱导食管癌细胞线粒体DNA编码基因过表达

以人食管癌细胞系EC109作为驱赶方（driver）,以被一氧化氮（nitric oxid,NO）诱导的EC109作为实验方（tester）,应用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)、反向mRNA斑点印迹和RNA印迹等技术手段研究了NO诱导的食管癌细胞中基因的过表达情况.然后对过表达基因的表达序列标签（expressed sequence tag,EST）实施序列测定,并与GenBank进行BLAST同源性比较和序列突变分析.结果先后两次从69个SSH阳性克隆中共鉴定出6个线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）编码的基因,即ND-4L、ND-4、COX-2、Lys-tRNA、ATP-8和ATP-6.表明NO可以诱导食管癌细胞mtDNA编码的基因过表达.另外,在ND-4L/ND-4基因的片段（10 736～11 449）上发现了三处同型单核苷酸置换（10 872 T→C, 11 001 A→G, 11 346 A→G）,在COX-2/Lys-tRNA/ATP-8/ATP-6基因片段（8 011～8 589）上发现了一处单核苷酸缺失（8 380 A）.氨基酸序列分析表明,在NO诱导的EC109中可能存在着一种结构异常的ATP-8肽链（一条在N端被截短的只有11个氨基酸残基的肽链,而正常的ATP-8肽链为68个氨基酸残基）.这些研究结果为深入揭示NO对肿瘤细胞的作用机制提供了新的重要线索.     

miRNA (microRNA)家族的研究进展

近年来 ,科学家在许多真核生物中发现了一类能时序调控发育进程 ,长度约为 2 1个核苷酸的小分子RNA ,并称其为miRNA (microRNA) .最近研究表明 ,它与早先在RNAi (RNAinterference)中发现的siRNA(smallinterferingRNA)具有很大的相关性 ,并在不同水平上参与了生物体内的遗传调控和基因重组等重要过程 .miRNA基因调控的特殊方式 ,高度的保守性 ,可能的加工机制以及它的发现所引发的讨论已引起人们的普遍关注     

利用酵母双杂系统筛选与春兰CgSEP1相互作用的蛋白

兰花形态优雅,花香馥郁,花形奇特,具有高度特化的花器官,观赏价值较高。有关兰花花器官形成分子机理以及基因组测序正在不断研究中。为了探讨兰花基因间相互作用情况,本研究以春兰为材料进行基因克隆,获得了18个花发育相关基因的编码序列,经测序鉴定分别属于ABCDE类MADS-box家族基因。再以其中春兰AP/AGL9组的CgSEP1为诱饵蛋白,亚克隆至pGBKT7质粒,构建诱饵载体,将18个蛋白编码亚克隆至pGADT7质粒。通过酵母双杂系统筛选到了3个与其互作的蛋白:pGADT7-AG1、p GADT7-SEP2、pGADT7-AGL6-3。结果表明,C类AG-like和E类SEP-like、AGL-like家族基因参与SEP1基因春兰花发育过程,并形成多种蛋白混合物,共同调控花瓣和萼片的形成,进一步揭示了春兰的成花机理。     

非洲爪蟾PAPC多克隆抗体的制备及其特异性鉴定

非洲爪蟾ParaxialProtocadherin(PAPC)是一个在爪蟾Spemann组织者特异表达的膜蛋白.它在爪蟾原肠运动阶段的汇聚延伸运动和体节发生阶段的体节边界形成,以及早期听泡的形态发生和细胞特化过程中都有重要的作用.为了研究PAPC基因在早期胚胎发育过程中的表达及其生物学功能,需要制备PAPC抗体.应用谷胱甘肽S-转移酶(glutathioneStransferase,GST)表达系统表达GST-PAPC融合蛋白,亲和纯化后用以免疫新西兰大白兔,获得PAPC多克隆抗体.免疫印迹分析发现,以1∶3000稀释的该多克隆抗体为一抗时,能够在转染了全长PAPC质粒的HEK293T细胞的蛋白质抽提物中,特异地识别出150ku的印迹条带.同时,GST-PAPC融合蛋白可以竞争性抑制该抗体对全长PAPC质粒转染细胞的蛋白质抽提物的特异性条带.用1∶500稀释的该抗体为一抗进行免疫荧光分析时,发现,PAPC多克隆抗体能够识别在HEK293T细胞中过表达以及爪蟾动物极细胞中过表达的PAPC蛋白,荧光信号定位在细胞膜上.免疫印迹分析证明,PAPC抗体能够识别爪蟾胚胎中内源表达的PAPC蛋白.     

分子标记鉴定常山胡柚优良基因型的初步研究

本研究利用RAPD和ISSR分子标记对常山胡柚的优良基因型进行鉴定,并探讨常山胡柚的起源。从100个RAPD引物中筛选出12个多态性引物用于正式扩增,共得到117条DNA带,其中多态性DNA带64条,占扩增片段的54．7%;从105个ISSR引物中筛选出11个多态性引物用于正式扩增,共得到94条DNA带,其中多态性DNA带58条,占扩增片段的61．7%。RAPD和ISSR分析揭示了常山胡柚及其近缘种的一些特异性条带。ISSR共产生了15条特异条带,RAPD共产生12特异性条带。实验数据用AMOVA软件计算遗传距离,用NTSYS-pc软件构建UPGMA聚类树状图。结果显示,所有的基因型及不同种之间均能够彼此区分,分析得到的指纹图谱对常山胡柚种和基因型的鉴定具有潜在的应用价值,可用于优良基因型的鉴定。聚类分析结果显示常山胡柚和甜柚聚为一枝,确定了甜柚是杂交亲本之一,但是常山胡柚和柚的遗传距离较远,说明常山胡柚可能是甜橙、柚和柑桔属其他种的多重自然杂交的结果。