蛋白质功能预测方法概述

蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子,对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的发展有着至关重要的作用。随着后基因组时代的发展,NCBI数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列,这些蛋白质序列甚至一跃成了研究的热点。近几十年来蛋白质功能预测的方法不断被完善。由最初的仅基于蛋白质序列或3D结构信息的方法衍生出更多的基于序列相似性、基于结构基序、基于相互作用网络等新方法,这些新型方法采用新的算法、新的研究思路和技术手段,力求得到准确性与普遍性并存,能够被广泛应用的蛋白质功能预测方法。本文综述了近年来蛋白质功能预测的方法,并将这些研究方法分类归纳,各自阐明了每类方法的优缺点。     

一个潜在的糖尿病新靶标——GPR40

G蛋白偶联受体40(GPR40)是典型的七次跨膜受体,在游离脂肪酸的刺激下,它能起到放大葡萄糖刺激的胰岛素分泌效应,是一种潜在的治疗糖尿病药物的靶标。另外,GPR40还被认为和一些神经类疾病以及某些癌症有关。本文着重叙述了游离脂肪酸经由GPR40放大葡萄糖刺激的胰岛素分泌机制,同时也介绍了GPR40的其他一些生理功能。     

虚拟筛选与新药发现

虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的研究进展,特别介绍了我国这方面研究的状况。     

γ-转角的研究进展

γ-转角是所有转角中数量位居第二的结构,约占整个蛋白质结构的3.4%。γ-转角有助于球形结构的形成,帮助肽链改变折叠方向,因此就更加有必要研究γ-转角的预测方法,从而提高蛋白质二级结构的预测精度。近几十年来关于γ-转角的预测方法越来越成熟,预测精度越来越高。本文综述了近年来对γ-转角研究进展,包括它的研究方法以及预测的准确度等。     

寡聚脱氧核苷酸d（CCGTACGG）质子共振谱线归属和溶液物象表征

寡聚脱氧核苷酸ｄ（ＣＣＧＴＡＣＧＧ）质子共振谱线归属和溶液物象表征王萍,石根斌,宋国强,陈凯先,嵇汝运（中国科学院上海药物研究所,２０００３１）关键词寡聚脱氧核苷酸;２ＤＮＭＲ;溶液构象石蒜内铵是一种新型ＤＮＡ嵌合剂,它可以显著改变ＤＮＡ螺旋的构象。...     

中国新药研究开发现状

随着国民经济的持续发展和生活水平的不断提高,健康状况与生命质量已经成为我国新时期社会发展的重大课题。人口老龄化和农村医药市场的拓展为生物医药产业提供了前所未有的成长空间。经过多年的不懈努力,我国自主的创新药物研究体系已经初步形成,以提升国际竞争力为导向,医药产业正在实现由仿制为主向创新为主的历史性转变。     

PPARγ激动剂的四种筛选方法

总结了目前国内外PPARγ激动剂的筛选方法,重点个绍了近年来刚发展起来的基于新技术的几种高通量筛选方法。     

创新药物研发的前沿动向与中国创新药物的发展近况

生命科学研究技术和手段是医学发展的重要基础。近年来,基因编辑、肿瘤免疫治疗、嵌合抗原受体T细胞免疫疗法、液体活检、大数据平台、再生医学、合成生物学、人工智能、3D打印等新策略和新技术的不断涌现,引领和推动了药物研发,产生了一批重要成果。精准医疗研究方向的兴起,要求临床过程中有精细的诊断,能够针对病人不同的情况来研发和精准用药。对创新药物研究的上述前沿动向作了概述,并回顾了中国从"九五"到"十二五"近20年新药研发取得的成就。"十三五"期间国家重大科技专项将重点聚焦药物品种研发、重大关键技术的研究与核心创新平台能力的建设。目前,中国新药研发存在的问题主要是原始创新能力不强、企业总体实力欠缺、顶层设计有待完善。面向新形势、新任务,中国新药研究要更多地针对新靶点、新机制,向着研制"同类第一"或"同类最优"的原始创新药物目标努力奋进。     

计算机辅助药物设计正在走向成功

计算机辅助药物设计是一门新兴的边缘学科,它的出现,大大加速了新药研制和开发的进程．本文列举了近３年来４个利用计算机辅助设计技术开发的已进入临床的药物例子,从中可以看出计算机辅助药物设计的重要价值和潜在优势,并证明计算机辅助药物设计正在走向成功．     

基于知识的蛋白质结构预测

介绍了近几年基于知识的蛋白质三维结构预测方法及其进展．目前,基于知识的结构预测方法主要有两类,一类是同源蛋白模建,这种技术比较成熟,模建的结果可靠性比较高,但只适用于同源性比较高的目标序列的模建;另一类方法即蛋白质逆折叠技术,主要包括3D profile方法和基于势函数的方法,给出的是目标蛋白质的空间走向,它主要可用于序列同源性比较低的蛋白质的结构预测．