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1.
陈作舟CHEN  Zuo-zhou 《遗传》2001,23(6):559-342
生物界存在一类筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代.主要有两类模式机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖细胞、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能.这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞的癌变正是从机制2退化为机制1的过程。 Abstract:Selective mechanisms exist in organism and biosphere,which select the cells with less DNA injuy and reproduces them.There are two models;Mechanisms 1 and Mechanisms 2,represented respectively b bacteria and mechanolytes of human beings.Cells with Mechanisms 1(e.g. bacteria,generative cells,cancer cells)can reproduce infinitely,while somatic cells can not.There are deep-going reasons behind the two categories of selective mechanisms.The canceration of the cells is a degenerating process from Mechanisms 2 to Mechanisms 1.  相似文献   
2.
陈作舟 《遗传》2001,23(6):559-563
生理界存在一类筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代。主要有两类模式-机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖细胞、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能。这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞2的癌变正是林合同制2退化为机制1的过程。  相似文献   
3.
GoPipe: 批量序列的Gene Ontology 注释和统计分析   总被引:7,自引:0,他引:7  
随着后基因组时代的到来,批量的测序,特别是 EST 的测序,逐渐成为普通实验室的日常工作 . 这些新的序列往往需要进行批量的 Gene Ontology (GO) 的注释及随后的统计分析 . 但是目前除了 Goblet 以外,并没有软件适合对未知序列进行批量的 GO 注释,而 GoBlet 因为具有上载量的限制,以及仅仅利用 BLAST 作为预测工具,所以仍有许多不足之处 . 开发了一个软件包 GoPipe ,通过整合 BLAST 和 InterProScan 的结果来进行序列注释,并提供了进一步作统计比较的工具 . 主程序接收任意个 BLAST 和 InterProScan 的结果文件,并依次进行文本分析、数据整合、去除冗余、统计分析和显示等工作 . 还提供了统计的工具来比较不同输入对 GO 的分布来挖掘生物学意义 . 另外,在交集工作模式下,程序取 InterProScan 和 BLAST 结果的交集, 在测试数据集中,其精确度达到 99.1% ,这大大超过了 InterProScan 本身对 GO 预测的精确度,而敏感度只是稍微下降 . 较高的精确度、较快的速度和较大的灵活性使它成为对未知序列进行批量 Gene Ontology 注释的理想的工具 . 上述软件包可以在网站 (http://gopipe.fishgenome.org/ ) 免费获得或者与作者联系获取 .  相似文献   
4.
DNA微阵列技术可同时定量测定成千上万个基因在生物样本中的表达水平,从这一技术获得的全基因组范围表达数据为揭示基因间复杂调控关系提供了可能。研究人员试图通过数学和计算方法来构建遗传互作的模型,这些基因调控网络模型有聚类法、布尔网络、贝叶斯网络、微分方程等。文章对网络重建计算方法的研究现状进行了较为全面的综述,比较了不同模型的优缺点,并对该领域进一步的研究趋势进行了展望。  相似文献   
5.
orthologs指起源于不同物种的最近的共同祖先的一些基因。orthologous的基因,具有相近甚至相同的功能,由相似的途径调控,在不同的物种中扮演相似甚至相同的角色,因此在基因组序列的注释中,是最可靠的选择。orthologs的生物信息预测方法主要有两类:系统发生方法和序列比对方法。这两类方法都是基于序列的相似性,但又各有特点。系统发生方法通过重建系统发生树来预测orthologs,因此在概念上比较精确,但难于自动化,运算量也很大。序列比对方法在概念上比较粗糙,但简单实用,运算量相对较小,因此得到了较广泛的应用。  相似文献   
6.
筛选机制与细胞衰老的DNA损伤假说   总被引:1,自引:0,他引:1  
生物界存在某些筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代。主要有两类模式--机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能。这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞的癌变正是从机制2退化为机制1的过程。  相似文献   
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