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生物界存在一类筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代.主要有两类模式机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖细胞、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能.这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞的癌变正是从机制2退化为机制1的过程。
Abstract:Selective mechanisms exist in organism and biosphere,which select the cells with less DNA injuy and reproduces them.There are two models;Mechanisms 1 and Mechanisms 2,represented respectively b bacteria and mechanolytes of human beings.Cells with Mechanisms 1(e.g. bacteria,generative cells,cancer cells)can reproduce infinitely,while somatic cells can not.There are deep-going reasons behind the two categories of selective mechanisms.The canceration of the cells is a degenerating process from Mechanisms 2 to Mechanisms 1. 相似文献
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生理界存在一类筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代。主要有两类模式-机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖细胞、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能。这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞2的癌变正是林合同制2退化为机制1的过程。 相似文献
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GoPipe: 批量序列的Gene Ontology 注释和统计分析 总被引:7,自引:0,他引:7
随着后基因组时代的到来,批量的测序,特别是 EST 的测序,逐渐成为普通实验室的日常工作 . 这些新的序列往往需要进行批量的 Gene Ontology (GO) 的注释及随后的统计分析 . 但是目前除了 Goblet 以外,并没有软件适合对未知序列进行批量的 GO 注释,而 GoBlet 因为具有上载量的限制,以及仅仅利用 BLAST 作为预测工具,所以仍有许多不足之处 . 开发了一个软件包 GoPipe ,通过整合 BLAST 和 InterProScan 的结果来进行序列注释,并提供了进一步作统计比较的工具 . 主程序接收任意个 BLAST 和 InterProScan 的结果文件,并依次进行文本分析、数据整合、去除冗余、统计分析和显示等工作 . 还提供了统计的工具来比较不同输入对 GO 的分布来挖掘生物学意义 . 另外,在交集工作模式下,程序取 InterProScan 和 BLAST 结果的交集, 在测试数据集中,其精确度达到 99.1% ,这大大超过了 InterProScan 本身对 GO 预测的精确度,而敏感度只是稍微下降 . 较高的精确度、较快的速度和较大的灵活性使它成为对未知序列进行批量 Gene Ontology 注释的理想的工具 . 上述软件包可以在网站 (http://gopipe.fishgenome.org/ ) 免费获得或者与作者联系获取 . 相似文献
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orthologs指起源于不同物种的最近的共同祖先的一些基因。orthologous的基因,具有相近甚至相同的功能,由相似的途径调控,在不同的物种中扮演相似甚至相同的角色,因此在基因组序列的注释中,是最可靠的选择。orthologs的生物信息预测方法主要有两类:系统发生方法和序列比对方法。这两类方法都是基于序列的相似性,但又各有特点。系统发生方法通过重建系统发生树来预测orthologs,因此在概念上比较精确,但难于自动化,运算量也很大。序列比对方法在概念上比较粗糙,但简单实用,运算量相对较小,因此得到了较广泛的应用。 相似文献
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筛选机制与细胞衰老的DNA损伤假说 总被引:1,自引:0,他引:1
生物界存在某些筛选机制,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来,产生后代。主要有两类模式--机制1和机制2,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表,那些具有筛选机制1的细胞(如:细菌、生殖、癌细胞)能无限传代,而体细胞则不能。这两类筛选机制背后有更深刻的原因,而细胞的癌变正是从机制2退化为机制1的过程。 相似文献
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