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1.
针对现有相关文献中离子通道电生理数据繁多且分散的特点,开发了一套电压门控离子通道电生理实验数据库。数据库中目前主要包括钠离子通道序列数据、调制剂分子结构和序列数据,并收集整理了文献中调制剂和通道相互作用时的电生理学数据和药理学数据。系统实现了数据的收集、录入、存储和查询,为后期进行数据挖掘奠定了基础。用户可以通过网址http://biodb.sgst.cn/DICE对数据库进行访问。  相似文献   
2.
对急性髓性白血病(AML)病人进行明确的亚型分类,有助于制定合适的治疗方案并预测其治疗效果。之前研究表明基因芯片技术在白血病亚型分类中已取得了较好效果,但由于儿童AML发病率较低,相应的芯片分析研究较少,因此目前用于构建儿童AML亚型分类模型的数据相对不足,是否可以应用现有的成人分类模型数据来对儿童AML进行预报还有待研究。应用基因芯片整合分析方法,对来自不同实验的研究成人或儿童AML亚型分类的基因芯片数据进行整合,应用支持向量机分析整合后数据集的亚型预报准确率。结果表明整合后的芯片数据在儿童AML亚型分类预报中的准确率达到97.24%,特征基因分析结果也说明在同一种AML亚型中,对于来自不同年龄组的样本,其特征基因有较高的表达相似性。  相似文献   
3.
王超  袁一  吴坚  郭景康  王健 《生物信息学》2009,7(3):171-177
通过分析研究核酸测序实验室的工作流程和管理体系,采用Java技术开发了一套基于实验流程管理的测序实验室的信息管理系统。系统为B/S体系,采用轻量级J2EE系统的分层架构,层次清晰、安全可靠,易于维护和扩展。系统实现了对实验流程的全方位跟踪管理,实现了对数据的采集、存储、整合、查询、导出等功能。系统的实施应用极大地提高了实验室的工作效率和管理水平。同时可为今后分子生物学、医学及其他学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。  相似文献   
4.
李泽  赵晓飞  沈翔  张国庆  郭景康  王健 《生物信息学》2010,8(4):347-349,355
利用Java AWT和JAI技术绘制生物图像的方法可以使在实验室中得到的生物实验数据自动转化为需要的图谱,并且图像的精确度高。绘制成的图像既可以保存在本地硬盘中,也可以在浏览器中以网页的形式展示出来供研究人员分析使用。该方法目前已在上海生物信息技术研究中心开发的可视化工具MapViewer和主题数据库H2H,SRA中得到应用。  相似文献   
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