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In order to develop a detailed physical map of the thermo-sensitive genie male-sterile (TGMS) gene-encompassing region and finally clone the TGMS gene, a high-quality rice bacterial artificial chromosome (BAC) library from TGMS rice 5460S was constructed. The method of constructing BAC library was examined and optimized. The 5460S library consists of 19 584 BAC clones with an average insert size of 110 kb, which represents about 5 times rice haploid genome equivalents. Rice inserts of up to 140 kb and 250 kb were isolated and appeared stable after 100 generations of serial growth. Hybridization of BAC clones with mitochondrial and chloroplastic genes as probes demonstrated that this library has no organellar contamination. The 5460S library was screened with 3 molecular markers linked to tmsl gene as probes and at least 1 BAC clone was identified with each probe. The insert ends of positive clones were successfully isolated using thermal asymmetric interlaced PCR (TAIL-PCR) technique. 相似文献
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温敏核不育水稻5460S细菌人工染色体文库的构建和鉴定 总被引:9,自引:0,他引:9
为了构建温敏核不育 (TGMS)基因区域的精细物理图谱并最终分离TGMS基因 ,以温敏核不育水稻 5 46 0S为材料 ,摸索优化了构建植物细菌人工染色体 (BAC)文库的方法 ,构建了一个高质量的BAC文库 .该文库由 1 95 84个克隆构成 ,插入片段平均长度为 1 1 0kb ,相当于水稻单倍体基因组大小的 5倍 ;以分子量分别为 1 40和2 5 0kb的 2个大BAC克隆进行稳定性传代实验 ,经 1 0 0代传代后其插入的DNA片段仍然稳定存在 ;以线粒体和叶绿体基因为探针筛选BAC文库 ,未检验出叶绿体和线粒体DNA的污染 ;以和tms1基因连锁的 3个分子标记作为探针对BAC文库进行了筛选 ,每个探针至少可获得一个阳性克隆 ,利用热不对称性交错PCR(Tail PCR)法成功分离了阳性克隆的左右末端序列 . 相似文献
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从植物细胞核分离大分子量核DNA 总被引:5,自引:0,他引:5
研究了从植物中分离百万碱基对级大分子量核DNA的方法。该方法利用差速离心分离植物细胞核,经低熔点琼脂糖块或低熔点琼脂糖微珠包埋,蛋白酶K原位裂解后制备大分子量核DNA。结果表明,选择不同生长时期的材料和不同的包埋细胞核方式对大分子量核DNA的制备有很大的影响,由黄化苗或幼嫩的绿叶为材料分离细胞核,进行胶块包埋是制备大分子量核DNA的最佳条件。利用该法获得的DNA分子量在200kb-5.7Mb之间,主要集中在2.2~5.7Mb之间;每一胶块DNAE量为18~20μg。与包埋原生质体制备大分子量核DNA的方法相比,该方法获得的DNA纯度较高,去除了大部分细胞器DNA的污染;易于被限制性内切酶部分和完全消化,其消化结果具可重复性。该方法操作简单、适用植物种类广泛,用该方法从水稻(OryzasativaL.)、苹果(MaluspumilaMill.)、大豆(Glycinemax(L.)Merr.)、玉米(ZeamaysL.)等多种植物材料中成功地制备了大分子量核DNA。该方法制备的核DNA适用于植物的脉冲交变电泳基因组分析和构建人工细菌染色体文库和人工酵母染色体文库。 相似文献
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miRNA广泛表达于神经系统,与疼痛的发生、发展密切相关。近年来研究表明,抑制miRNA的合成调制伤害性神经元对炎症刺激的反应。疼痛时,背根神经节(DRG)上miRNA明显下调,该变化参与炎性疼痛和神经性疼痛的产生和维持。同时,miRNA也可以下调Navα亚基、ASIC3、TRPV1和P2X7mRNA的表达水平,还可以降低Kv电流。因此,miRNA可能成为疼痛治疗的新靶点。综述了miRNA的生物起源、分布,及其对痛觉相关离子通道Nav、Kv、ASICs、TRPV1以及嘌呤受体的调节作用。 相似文献
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