癫痫相关基因SCN1A启动子区多态性位点的生物信息学分析

SCN1A是多种神经系统疾病的致病基因,该基因的精确表达对于维持神经系统正常功能非常重要.为了认识SCN1A启动子区多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的保守性及其功能意义,应用生物信息学方法分析了目前已发表位于SCN1A启动子区的11个SNPs,分别命名S1～S11.分析结果表明,S3、S5和S7等位基因频率没有人种差异性,其余SNP等位基因频率均有人种差异性;接近核心启动子的SNPs要比远离核心启动子SNPs的保守程度高,提示靠近核心启动子的SNPs影响SCN1A基因表达的概率可能越大;大部分SNPs祖传等位基因在哺乳动物中是保守的(S3除外),暗示这些SNPs新生等位基因有可能在人类进化过程起到一定的作用:启动子分析软件预测发现,含S2、S4、S8及S9等4个SNPs不同等位基因的同一序列分别存在不同转录因子结合元件,而含S1和S11不同等位基因的同一序列都只能预测到含其中一个等位基因的序列存在转录因子结合元件,这些差异可能是SNPs影响SCN1A表达的重要原因之一.这些分析将为进一步研究SCN1A启动子区SNPs与神经系统疾病的相互关系打下基础.     

肾神经传入纤维在DOCA─salt大鼠高血压形成中的作用

于大鼠皮下埋入含醋酸去氧皮质酮（ＤＯＣＡ）的硅胶管以形成ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压,其中一组动物在埋管前切除（Ｔ＿９－Ｌ＿２）脊髓右侧背根神经,每周以尾套法测定大鼠收缩压,埋管后６周测定大鼠脑和血浆中儿茶酚胺（ＣＡ）和血管紧张素Ⅱ（ＡｎｇⅡ）的浓度,用电脑血管显微图像分析系统测量血管的结构变化。与对照鼠相比,ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压大鼠下丘脑和延脑的肾上腺素含量和ＡｎｇⅡ放免活性及血浆去甲肾上腺素（ＮＥ）浓度均明显增加,血浆ＡｎｇⅡ浓度降低,心系数（心重／体重）和肠系膜动脉的中层厚度、壁厚与腔径（壁腔）比值增大;切除脊髓背根可明显延缓ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压的形成、预防以上组织ＣＡ浓度和ＡｎｇⅡ放免活性增加以及缓解心肌和血管平滑肌的肥厚。提示,肾神经传入纤维在ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压形成中起作用,其机制可能通过影响脑内肾上腺素能神经元和激活脑肾素－血管紧张素系统增加交感传出而起作用。     

人及小鼠钠通道SCN3A基因的启动子及其上游调控区的分析

为了比较研究人与小鼠SCN3A基因的启动子及其上游调控区的特征,采用5′-Full RACE方法对人及小鼠SCN3A基因的转录起始点进行了准确定位,通过序列测定及对比分析证明：确定人和小鼠SCN3A基因的转录起始点均为“A”,人SCN3A基因转录起始点位于翻译起始点上游约27 kb处,而小鼠位于翻译起始点上游约31 kb处．人SCN3A基因5′非翻译区存在两个5′非翻译外显子,而小鼠只有一个5′非翻译外显子．人和小鼠SCN3A基因核心启动子区(-80 ～+70)的同源率高达96.0%,存在相同的启动子核心元件,BRE/和TATA;在-400至+200区段内预测到人存在而小鼠不存在的转录因子有PHR1、GATA-1、FOXN2、NF-1及AP-4,小鼠存在而人不存在的转录因子Sp、Sp3及GBF．人和小鼠SCN3A启动子区特征的异同将为进一步研究该基因在人和小鼠的表达调控机制提供重要线索．     

肾神经传入纤维在DOCA—salt大鼠高血压形成中的作用

于大鼠皮下埋入含醋酸去氧皮质酮（ＤＯＣＡ）的交管以形成ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压,其中一组动物在埋管前切除（Ｔ９－Ｌ２）脊髓右侧背根神经,每周以尾套法测定大鼠收缩压,埋管后６周测定大鼠脑和血浆中儿茶酚胺（ＣＡ）和血管紧张素Ⅱ（ＡｎｇⅡ）的浓度,用电脑血管显微图像分析系统测量血管的结构变化。与对照鼠相比,ＤＯＣＡ－ｓａｌｔ高血压大鼠下丘脑和延脑 肾上腺素含量和ＡｎｇⅡ放免活性及血浆去甲肾上腺素（ＮＥ）     

人及小鼠钠通道SCN3A基因的启动子及其上游调控区的分析

为了比较研究人与小鼠SCN3A基因的启动子及其上游调控区的特征,采用5′-Full RAGE方法对人及小鼠SCN3A基因的转录起始点进行了准确定位,通过序列测定及对比分析证明:确定人和小鼠SCN3A基因的转录起始点均为"A",人SCN3A基因转录起始点位于翻译起始点上游约27 kb处,而小鼠位于翻译起始点上游约31 kb处.人SCN3A基因5′非翻译区存在两个5′非翻译外显子,而小鼠只有一个5′非翻译外显子.人和小鼠SCN3A基因核心启动子区(-80～+70)的同源率高达96.0%,存在相同的启动子核心元件,BRE/和TATA;在-400至+200区段内预测到人存在而小鼠不存在的转录因子有PHR1、GATA-1、FOXN2、NF-及AP-4,小鼠存在而人不存在的转录因子Sp、Sp3及GBF.人和小鼠SCN3A启动子区特征的异同将为进一步研究该基因在人和小鼠的表达调控机制提供重要线索.     

结合单酶切位点的融合PCR技术对SCN1A基因的定点诱变

目的:利用结合单酶切位点的融合PCR技术对癫痫相关基因SCN1A进行定点突变。方法:首先设计两对引物PF1/PR1和PF2/PR2,PF1和PR2均位于突变位点最近的单酶切位点处,而突变位点设计在第一对反向引物(PR1)和第二对正向引物上(PF2)。通过重叠延伸法两次PCR扩增:第一次用PF1/PR1和PF2/PR2分开扩增,以扩增产物作模板,PF1/PR2作引物进行融合PCR,得到的扩增产物即含有所需要的突变位点,最后将扩增片段克隆入pMD18-T载体,经测序筛选阳性克隆。结果:DNA测序表明SCN1A基因所编码的第946位密码子由精氨酸(Arg)突变为组氨酸(His),再通过酶切和连接反应将重组质粒上的突变片段替换SCN1A表达质粒上的对应片段,成功构建了SCN1A突变载体。结论:与现在常用的长距离PCR定点诱导突变相比较,结合单酶切位点的融合PCR定点突变技术具备扩增距离短的优点,大大降低了自发突变的概率,适合于大肠杆菌中易自发突变的较大载体的定点诱变。