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采样自云南同一种群的中华菊头蝠共16个个体,用于DRB基因的分子进化和多态性研究。利用翼膜组织提取DNA基因组,并PCR克隆测序分析。获得了相差3 bp的两种不同长度序列类型,A序列类型263 bp,在研究群体中有15个等位基因;B序列类型260 bp,在研究群体中有8个等位基因。在分析的74个氨基酸变异位点上检测到12个正向选择位点。在9个个体中检测到分布频率最高的等位基因,也有多个等位基因只存在一个个体中。单个个体中最多存在6个等位基因。遗传多态性分析表明中华菊头蝠DRB基因具有较高的多态性。中华菊头蝠DRB基因可能至少存在3个重复座位。利用已发表的翼手目DRB第二外显子序列构建的系统进化树表明中华菊头蝠MHCⅡ-DRB基因处于独立进化支。 相似文献
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对1株梅花鹿源性狂犬病街毒株(DRV)进行全基因组克隆,对全长cDNA进行测序分析.RT-PCR扩增克隆覆盖全基因组9个重叠基因片段,基因组3'和5'末端采取3,-RACE和5'-RACE方法,9个重叠基因片段序列拼接得到DRV全基因组cDNA序列,共11 863个核苷酸.DRV毒株全基因组构成与其他狂犬病毒基因组构成相似,由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,在核蛋白和糖蛋白的重要抗原位点有个别氨基酸发生变异,对已完成全基因组测序的几个基因1型毒株分别进行了N、P、M、G、L基因核苷酸及氨基酸的同源性比较.与其他具有代表性的毒株进行N基因序列比较建立的系统进化树表明,DRV毒株属于基因1型,与中国人用疫苗株3aG同源性最高为94%,与分类位置未确定的北高加索毒株(WCBV)的同源性最低为71%.本研究结果可为狂犬病毒各项分子生物学研究提供理论参考. 相似文献
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