基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对阪崎肠杆菌的鉴定

目的 利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法对阪崎肠杆菌进行鉴定,建立一种高效检测阪崎肠杆菌的方法,并为该技术的推广使用及阪崎肠杆菌的进一步研究提供科学依据.方法 用MALDI-TOF-MS法检测38株野生阪崎肠杆菌、2株标准菌株和1株阴沟肠杆菌,结果与常规生化鉴定结果对比;同时对在不同培养基上培养的阪崎肠杆菌进行质谱分析比较,对比不同培养基对质谱结果是否有影响;对38株野生菌株质谱图进行聚类分析.结果 38株菌株鉴定结果均为阪崎肠杆菌,与生化鉴定结果一致,且质谱鉴定分值大多在2.0以上.通过MALDI-TOF-MS鉴定方法可以很明显地将阴沟肠杆菌与阪崎肠杆菌两种菌分开.4种培养基对MALDI-TOF-MS鉴定结果的影响不是很明显,TSA比较适合作为阪崎肠杆菌MALDI-TOF-MS鉴定的培养基.通过质谱图谱和离子峰值比较得出,所有菌株在5745 m/z附近均出现高的离子峰,在2871、4740、8288、6260和9488 m/z附近出现离子峰的实验菌株达95％以上;在差异水平在0.5时,MALDI-TOF-MS的聚类分析结果可将所有实验菌株分成5个类型,结合菌株对应的来源和种类分析表明本研究所用菌株与来源和种类之间并无明显关系.结论 MALDI-TOF-MS方法具有准确且精确鉴定阪崎肠杆菌的能力;离子峰5745m/z具有作为阪崎肠杆菌的标记性离子峰的可能;差异水平为0.5进行MALDI-TOF-MS聚类分析,未发现5个类型与来源等具有一定关系,需要进一步研究.     

中国征收碳税应对碳关税的经济分析——以美国为例

碳税和碳关税作为一种价格调整机制,长期而言会对经济系统中各主体产生较强的约束力。通过GTAP-E模型的模拟分析,得出以下结论:在目前的发展阶段,碳关税并非有效的低碳经济发展政策,尤其是美国对中国征收碳关税对降低世界碳排放量的影响有限;美国针对中国采取的碳关税政策将在一定程度上对我国出口贸易产生负向影响,尤其是对中国的高碳产业影响较大;当中美采取相同的碳税政策时,碳税的征收对中国GDP造成较大的负面影响,且中国自主采取节能减排方案不足以应对美国碳关税的负面效应;而当两者采取差异化政策时,中国主动采取节能减排行动可以有效应对美国碳关税的威胁。     

不同妊娠状态下女性口腔微生物的结构差异性

【背景】妊娠期妇女口腔微生物改变与口腔疾病及全身性疾病之间有显著相关性。【目的】比较不同妊娠状态下女性口腔微生物结构的差异,探讨该差异与不同妊娠状态间的关联性。【方法】选取18名孕妇和9名非孕妇为研究对象[（28.2±3）岁],分为妊娠期糖尿病组[gestational diabetes mellitus,GDM,年龄（28.9±3.6）岁,孕周（30.1±3.2）周]、妊娠期非糖尿病组[non-diabetic pregnant women,PW,年龄（27.9±3.0）岁,孕周（28.6±4.7）周]和非妊娠期非糖尿病组[non-pregnant women,NPW,年龄（27.7±2.1）岁],每组9名,收集口腔唾液（saliva,S）和龈上牙菌斑（supragingival dental plaque,D）,采取Illumina Novaseq测序平台针对细菌16S rRNA基因的V3-V4可变区进行测序,以SILVA为参考数据库使用朴素贝叶斯分类器对特征序列进行分类学注释,利用QIIME软件对样本进行生物信息学分析。【结果】三组中唾液及牙菌斑微生物差异比较显示：D-GDM中二氧化碳嗜纤维菌属检出量高于D-PW,而月形单胞菌属检出量显著低于D-PW;S-GDM中产气单胞菌属、拟杆菌属等厌氧菌属检出量高于S-PW,韦荣氏菌属检出量低于S-PW;D-PW中纤毛菌属、普氏菌属和月形单胞菌属检出量显著高于D-NPW;D-NPW中产气单胞菌属、放线杆菌属、二氧化碳嗜纤维杆菌属、奈瑟菌属、链球菌属和劳特罗氏菌属等检出量高于D-PW;S-PW中韦荣菌属、普氏菌属、链球菌属和卟啉单胞菌属检出量低于S-NPW;D-GDM中福赛斯坦纳菌属、纤毛菌属检出量高于D-NPW,劳特罗氏菌属检出量低于D-NPW;S-GDM中密螺旋体属、弯曲杆菌属检出量高于S-NPW,链球菌属低于S-NPW。在种水平上,S-GDM菌群中具核梭杆菌检出量显著高于S-PW,S-GDM菌群中牙龈卟啉单胞菌及福赛斯坦纳菌检出量与S-PW差异无统计学意义,产黑普氏菌检出量低于S-PW;S-PW中牙龈卟啉单胞菌、产黑普氏菌和福赛斯坦纳菌检出量均显著高于S-NPW。【结论】孕妇妊娠期糖尿病将增加口腔微生物群厌氧菌检出率,GDM与牙龈卟啉单胞菌、福赛斯坦纳菌和产黑普氏菌等牙周炎致病菌相关性不能确定。     

海水派琴虫检测方法研究进展

牡蛎（Crassostrea virginica）被称为“海洋牛奶”,有望成为21世纪人类重要的蛋白质供应源,其产业化养殖和开发已遍及全球。我国每年牡蛎的产量居世界首位,约占我国海洋水产养殖总产量的三分之一,已成为沿海地带的支柱产业。     

生物专业教学中大学生沟通与表达能力的提升

沟通与表达能力是大学生综合能力的重要组成部分。本文探索了在生物专业教学中提高大学生沟通与表达能力的途径,开展了丰富多彩的教学活动,并对提升训练中的相关问题进行了思考。通过趣味知识演讲、习题课、课堂讨论等方式,扩展学生的知识面,激发学习兴趣,提高了学生的沟通与表达能力。     

中国林蛙核糖核酸酶Rdrlec新基因的原核可溶表达

来源于蛙属的核糖核酸酶由于具有显著的抗肿瘤活性而备受关注,Rdrlec是从中国林蛙基因组中克隆得到的核糖核酸酶新基因。获得大量高纯度野生型重组蛋白是研究其功能的基础。按照大肠杆菌偏好的密码子人工合成Rdrlec基因,通过EcoR I和Hind III位点插入到表达载体pET-32a(+)中构建pET32-Rdrlec重组表达质粒,转化到Escherichia coli BL21(DE3)中,0.4 mmol/L IPTG 30℃诱导6 h后,融合蛋白主要以可溶形式表达,经过Ni-NTA亲和纯化和Sephadex G75层析纯化,得到电泳纯融合蛋白。肠激酶切割后得到Rdrlec野生型重组蛋白,具有降解RNA的酶活性,证明分子的空间结构已经正确形成。Rdrlec野生型重组蛋白表达成功,为后续蛋白结构与功能的研究以及进一步的开发应用提供了原料。     

贝类毒素体外细胞毒性作用研究进展

贝类毒素属于非蛋白类高分子化合物,高温处理不能使之失活,严重影响着贝类食品的安全和我国贝类产品的出口贸易。目前贝类毒素最主要的检测方法是小鼠生物法(MBA),然而随着3R理念的推动,毒性评价的体外细胞毒性替代研究取得很大进展,本文综述了8组贝类毒素体外细胞毒性作用的研究成果。     

P119驱动amiRNA介导的PL基因沉默对草莓果实硬度的影响

果胶裂解酶基因(Pectate lyase,PL)是调控果实软化的重要靶点。本研究测定了红颜草莓果实在发育过程中果胶裂解酶活性变化和硬度变化规律,并通过人工小干扰RNA(artificial micro-interfering RNA interference,amiRNA)技术,以拟南芥miR390a前体序列作为沉默PL基因的骨架,在番茄果实特异性启动子P119的驱动下,通过农杆菌介导转入草莓果实中瞬时表达,通过RT-PCR分析草莓瞬时转染后PL基因的表达量,并检测了PL沉默对果实硬度的影响。结果表明,随着草莓果实发育的推进,果胶裂解酶活性呈逐渐上升趋势,与果实硬度呈负相关;构建了基于拟南芥miR390a为骨架的amiRNA靶向栽培草莓中的PL基因;在番茄果实特异性启动子P119驱动下,miRNA前体可以在草莓果实中瞬时表达;草莓果实中总PL基因表达量下降达34. 5%;基因沉默组果实硬度比对照组更高,且沉默对果实颜色发育进程无明显影响。该结果表明:果胶裂解酶主要在果实发育后期调节细胞壁的解离,采用amiRNA沉默PL基因可以延缓草莓果实软化进程。     

草莓FaHYH基因的序列特征与时空表达特性分析

以‘丰香’草莓为研究材料,通过同源克隆得到FaHYH基因及其启动子序列,并对其进行相关生物信息学分析及启动子顺势作用元件分析,采用sq-PCR及RT-qPCR技术分析其时空特异性表达模式。研究表明:FaHYH基因开放阅读框为522 bp,编码173个氨基酸,蛋白质分子量为19.76 kD,理论等电点为9.36。蛋白保守域分析显示,FaHYH蛋白C端含有一个典型的亮氨酸拉链结构,是一个非分泌型核定位蛋白。同源性及进化树结果表明,草莓HYH在进化过程中具有高度保守性。启动子序列分析显示其包含大量的光应答元件(Box 4, Box I, I-box)等与非生物胁迫相关的顺式元件。荧光定量PCR分析表明,FaHYH基因随着草莓果实发育时期的推进,其表达量逐渐上升;在各组织器官中存在表达特异性,在花中表达量最高,根中表达量最低。本研究分离鉴定了草莓光诱导中的bZIP转录因子的HYH基因,分析了其时空表达模式,为进一步研究该基因的功能和作用机制提供基础数据。