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1.
鲫鱼生长激素Ⅰ基因内含子2的多态性分析   总被引:11,自引:0,他引:11  
利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Denaturing-Polyacrylamid Gel Electrophoresis,DPAGE)和单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析技术,在普通鲫鱼种群(7个野生鲫鱼群体和2个金鱼群体)和银鲫种群(1个方正银鲫群体)共162个个体生长激素Ⅰ(Growth HormoneⅠ,GHⅠ)基因的内含子2中检测到丰富的长度和序列多态性。在所有群体中,GHⅠ基因内含子2的长度存在7种类型,分别为A、B、c、D、E、F和G型,变异频率为4.32%;其序列存在15种单倍型,分别为Al、A2、A3、B、c1、C2、Dl、D2、D3、D4、D5、E1、E2、F和G型,变异频率为9.26%。对这15种单倍型的DNA序列进行分析,结果表明:1)鲫鱼GHⅠ基因内含子2的扩增DNA片段长为243~263bp,其中包括部分外显子2(3’端,33bp)、内含子2和部分外显子3(5’端,2lbp)。15种单倍型A、T、G、C碱基平均百分比组成分别为34.13%、37.36%、15.130A,、13.38%,其中G C(28.5l%)含量明显小于A T(71.49%)含量。内含子2与外显子2、3的接头区存在GT-AG保守序列,此为真核基因中mRNA剪接的识别信号。内含子2的5’端存在有一序列为GTAAGAT的保守区域,在其近3’端分布有一高丰度嘧啶区;2)内含子2的7种长度类型A、B、C、D、E、F和G型分别为189、196、204、205、206、207和209bp,其差异主要由单碱基T重复次数N不同(Ⅳ:0、8、9、10、11和13)和3种序列(TGAAAAC、TT和GAGTG)中1种或2种序列的缺失所引起;3)内含子2的15种单倍型的核苷酸序列中共有17个突变位点,包括2个碱基颠换突变位点和15个碱基转换突变位点,碱基转换突变频率为88.24%,明显高于颠换突变频率(11.76%)。普通鲫鱼种群中金鱼群体D11b、Dhr的GHⅠ基因内含子2均为长度类型A,含有两种序列单倍型(以下简称单倍型)即A1和A2;野生鲫鱼群体的内含子长度和序列变异较大,检测到A、B、C、D、E、F、G7种长度类型和14种单倍型(A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、E1、E2、F和G型)。在银鲫种群CaG中检测到c和D两种长度类型和4种序列单倍型(C1、C2、D2和D5),其中D5仅在此种群中检测到。  相似文献   
2.
斑马鱼窖蛋白-1基因cDNA克隆及功能初步研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
窖蛋白-1(Cav-1)是胞膜窖的主要结构蛋白,可与多种信号分子相互作用,调节细胞的增殖、分化和凋亡,其异常表达与多种人体疾病的发生和发展密切相关,而在斑马鱼发育中的功能尚不很清楚.研究克隆出斑马鱼窖蛋白-1基因两个亚型的全长cDNA,与其他物种窖蛋白-1的氨基酸序列进行比较,发现该蛋白在脊椎动物中非常保守.利用逆转录多聚酶链反应检测发现,在斑马鱼多个成年组织中窖蛋白-1的两个亚型均有转录表达.利用胚胎整体原位杂交检测组织或器官特异基因的时空表达变化发现,过表达或利用Morpholino反义寡聚核苷酸(MO)抑制cav-1a的表达可影响脊索和体节的发育,而过表达或MO抑制cav-1β可导致肝脏发育的异常;此外,过表达或MO抑制cav-1a或-1β均可影响斑马鱼神经系统的发育.因此,斑马鱼Cav-1在维持组织器官的生理功能和调控胚胎的正常发育中起着重要作用.  相似文献   
3.
6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析   总被引:11,自引:0,他引:11  
通过RT-PCR、3′RACE、5′-RACE方法,从6种重要经济鱼类——大眼鳜(Siniperca kneri)、石斑鱼(Epinephelus coioides)、黄鳝(Monopterus albus)、鲶鱼(Silurus asotus)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)和方正银鲫(Carassius auratus gibelio Bloch,Fang Zheng crucian carp)中克隆了生长激素(Growth Hormone,GH)的完整cDNA序列(除石斑鱼序列外,其他生长激素序列均系第一次克隆),并详细分析了其序列特征。测序结果显示,克隆的6种GH cDNA长度依次为953bp、1023bp、825bp、1082bp、1154bp和1180bp,它们均包含一个长度为600个左右核苷酸的完整阅读框,分别编码一个200个左右氨基酸的蛋白:大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为204个氨基酸,鲶鱼GH为200个氨基酸,泥鳅和方正银鲫GH为210个氨基酸。这6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基,其中的大多数聚集而成5个保守域。基于这6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析,结果(MP和NJ树)与根据形态特征构建的系统发育树基本一致,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元(目间、目以上)的系统发育研究方面比较一致,尽管仍存在一定差异,说明生长激素基因的编码区应该在硬骨鱼类系统发育研究领域得到更多的重视。  相似文献   
4.
白额巨蟹蛛对红头丽蝇捕食行为的初步观察   总被引:1,自引:0,他引:1  
本文首次报道了在实验条件(温度19~23 ℃、相对湿度80 %)下白额巨蟹蛛对红头丽蝇的捕食行为和捕食功能反应的初步观察结果,并用Holling-Ⅱ型功能反应模型进行拟合,白额巨蟹蛛捕食红头丽蝇的功能反应直线回归方程为:NA=1.0031 N/(1 0.0626 N).本研究结果,可以为蜘蛛控制卫生害虫提供理论依据.  相似文献   
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