应用死端排除法考虑分子对接中的侧链柔性

假设分子对接面的紧密堆积类似于蛋白质内部的紧密堆积,因此用于蛋白质内部的侧链构象预测方法,如死端排除法,可应用于分子对接面内的侧链构象预测。应用９个晶体结构对这一假设进行检验。结果表明假设基本正确。对２个蛋白酶和抑制剂的应用比较成功。９个配体中的７个有正确的均方根差的趋势。还发现受体结构的柔性较小,说明由于对接面的紧密堆积产生的侧链构象变化很小。根据这些结果,提出一个新的分子对接流程图,即在刚体对     

应用死端排除法考虑分子对接中的侧链柔性

假设分子对接面的紧密堆积类似于蛋白质内部的紧密堆积,因此用于蛋白质内部的侧链构象预测方法,如死端排除法,可应用于分子对接面内的侧链构象预测。应用９个晶体结构对这一假设进行检验,结果表明假设基本正确。对２个蛋白酶与抑制剂的应用比较成功。９个配体中的７个有正确的均方根差的趋势。还发现受体结构的柔性较小,说明由于对接面的紧密堆积产生的侧链构象变化很小。根据这些结果,提出一个新的分子对接流程图,即在刚体对接后加入对接面中氨基酸残基的侧链构象预测。对一个蛋白酶与抑制剂的复合结构的应用表明对接中的正确解的信号与噪音比相对错误解增加了。     

我国主要河口沉积物中多环芳烃细菌降解及生物修复强化方式的研究进展

河口是海洋及陆地交互作用的集中地带,其生态环境的健康状况对所在地区人类居住及社会经济的可持续发展十分重要。近年来,河口城市的快速发展导致了大量的多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)在河口沉积物中积累,持久地影响水生生态系统的健康,其降解与转化逐渐成为近年来的研究热点。本文总结发现,我国主要河口(珠江口、长江口、辽河口、海河口)沉积物中的PAHs降解菌主要分布于假单胞菌门、放线菌门及芽孢杆菌门,其中克雷伯氏菌属、芽孢杆菌属及假单胞菌属报道较多。在河口沉积物中,PAHs的细菌降解主要是通过低效率的厌氧降解途径。低氧、高盐度是PAHs细菌降解的不利条件,温度与pH值的变化也为实地生物修复的应用效率带来了不确定性。表面活性剂、营养物与外源电子受体的添加以及共代谢作用均可促进沉积物细菌对PAHs的降解。目前多数研究以实验室规模开展,而河口沉积物生境复杂,建议未来针对河口沉积物的环境特点进行PAHs降解功能菌株种质资源的挖掘,并根据实际情况灵活制定强化策略。本综述为进一步从我国主要河口沉积物中筛选PAHs高效降解菌及其利用提供了思路与参考。     

脑小血管病患者血清尿酸水平和步态障碍之间的相关性

目的:探讨脑小血管病(Cerebral small vessel disease,CSVD)患者血清尿酸(Uric acid,UA)水平和步态障碍之间的相关性。方法:将我院自2018年1月至2019年1月收治的CSVD患者172例作为研究对象,根据患者血清尿酸水平分为研究组87例,对照组85例。收集和比较两组的临床资料,使用Logistic回归分析血清尿酸和CSVD患者脑室旁、深部白质高信号、步态障碍之间的相关性。结果:两组的年龄、性别、体质指数、血糖指标、血脂指标水平,合并高血压、糖尿病病史和吸烟情况比较差异无统计学意义(P0.05)。研究组血清尿酸水平、饮酒患者比例明显高于对照组(P0.05),脑室旁高信号和深部白质高信号中重度比例均明显高于对照组(P0.05);将步态障碍、脑室旁高信号与深部白质高信号作为影响因素带入相关分析,结果显示血清尿酸水平与步态障碍、脑室旁高信号与深部白质高信号比较存在正相关(P0.05)。结论:CSVD患者血清高尿酸水平与脑室旁、深部白质高信号病变程度呈明显的正相关性,也是患者步态障碍的影响因素。     

细菌三型分泌系统输出蛋白分泌信号研究进展

自提出三型分泌系统的概念以来,相关分子机制的研究让人们对其有了更深入的了解。与依赖信号肽分泌途径形成鲜明对比的是,蛋白通过细菌三型分泌系统分泌或者转运时没有可识别的保守信号序列。近期对三型分泌蛋白的研究发现了多种可以引导其分泌的分泌信号。本文分别介绍了细菌三型分泌系统的种类,分泌系统分泌蛋白的种类,并着重阐述了分泌信号的分子特性及其机制,以期为新型抗菌药物的研发提供新的思路。     

广西黑熊资源调查及保护对策

2007-2008年采用样带法实地调查和分布区社会调查对广西的黑熊(Selenarctos thibetanus)资源进行调查.结果表明,广西的黑熊资源仅分布在桂北、桂西北和桂西南的部分山地林区,数量在112～157只左右,分布区面积约为5 629 km2.栖息地的丧失以及破碎化和大量的捕杀是野生黑熊资源长期生存的最大...