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新疆地区盐湖的中度嗜盐菌的数值分类 总被引:4,自引:0,他引:4
对来自新疆地区盐湖的 2 9株中度嗜盐菌与 9株相关的参比菌株进行了数值分类。这些菌株是革兰氏阴性菌 ,能在 0~ 2 5 %NaCl中生长。结果表明 ,所有菌株在 76 %的相似性水平上分为 2个表观群。群I为新分离的菌株共 2 5株 ,群II为 9株参比菌株和 4株新分离的菌株。在 86 %的相似性水平上 ,供试菌株分为 3个亚群。亚群 1由 1 0株新分离的菌株组成 ,亚群 2由 8株新分离的菌株组成 ,亚群 3由 1株新分离的菌株和 5株参比菌株组成。大部分新分离的菌株聚在独立的亚群中 ,说明分离 相似文献
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新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析 总被引:19,自引:1,他引:18
通过数值分类和16S rDNA PCR-RFLP分析,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究,发现了一个新类群。在此基础上,进行了中心株AI-3的16S rDNA全序列分析,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较,得到系统发育树状图。在此树状图中,大多数参比菌株聚在一起,其16S rDNA全序列的同源性在96%以上,而AI-3与参比菌株的16S rDNA全序列相比,其相似性低于75%。但是,AI-3与Alcanivorax borkumensis^[1]的16S rDNA全序列的相似性为96%,与Halobacillus litoralis的16S rDNA全序列的相似性为99%,三者构成一个独立的发育分支。这说明在系统发育上,AI-3与参比菌株属于不同的分支,是一个新的类群。在新类群内,菌株之间的DNA同源性大于70%,而中心株AI-3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)的DNA同源性为44%,表明新分离的菌株可能构成一个新种群。 相似文献
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新疆地区盐湖的中度嗜盐菌的16S rDNA PCR—RFLP分析 总被引:6,自引:0,他引:6
对来自新疆地区艾丁湖、艾比湖和玛那斯盐湖等盐湖的28株中度嗜盐菌与9株相关的参比菌株,进行了16S rDNA PCR-RFLP分析,这些菌株是革兰氏阴性杆菌,能在0~25%NaCl中生长。在实验中,选用4种限制性内切酶AluⅠ、HinfⅠ、RsaⅠ和HaeⅢ,将供试菌株的16S rDNA的PCR产物进行酶切,用3%的琼脂糖电泳分析酶切产物。结果表明,在74%的相似性水平上分为3群。群Ⅰ包括新分离的 相似文献
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