赤拟合盗模拟种公畜选择—常规与改进方法的比较

本实验用实验昆虫赤拟谷盗两个世代各３０个家系的８５９和７２６只桶的２３日龄蛹长和肾宽作为选择性状模拟种公畜选择,对常规方法和改进方法进行比较。以Ｈｅｎｄｅｒｓｏｎ方法ＩＩＩ和综合指数作为常规方法,用约束最大似然法和ＢＬＵＰ估计方差组分和育种值为改进方法。结果表明,常规法估计遗传参数在两世代中不稳定,而改进方法弥补此缺点,对两世代个体和家系育种值排队,结果表明两种方法在前几名无差别,说明在选择强度大     

母猪繁殖力性状影响因素分析及遗传参数估计

母猪繁殖力是影响种猪场经济效益的重要因素。文章对纯种大白猪、长白猪、杜洛克猪的8491窝产仔记录进行统计分析, 建立固定效应模型对总产仔数、健仔数、初生窝重、弱仔数、死胎数、木乃伊胎数和畸形胎数共7个繁殖性状进行最小二乘分析, 分析胎次、配种季节、品种对母猪繁殖性能的影响, 同时比较了纯繁和杂交的效果。利用动物模型REML(约束最大似然)方法估计繁殖性状的遗传力和遗传相关。结果表明, 胎次、配种季节和品种对总产仔数、健仔数、初生窝重影响极显著(P<0.001), 胎次和品种对弱仔数影响极显著(P<0.001), 但配种季节对弱仔数影响不显著。胎次对死胎数影响显著(P<0.05), 而配种季节和品种对死胎数影响不显著, 胎次、配种季节和品种对木乃伊胎、畸形胎数影响不显著。长白♂×大白♀交配组合具有最高的总产仔数、健仔数和初生窝重。繁殖性状遗传力估计结果显示, 长白猪初生窝重的遗传力最高, 为0.227。其余性状遗传力均在0.2以下, 为低遗传力性状。3个品种母猪的健仔数与初生窝重、总产仔数与健仔数之间的遗传相关达0.96以上。研究结果为降低非传染性因素造成的种母猪产仔数低的问题以及种猪场对母猪繁殖力的选育提高提供了参考数据和理论依据。     

基于DNA池测序法筛选奶牛高信息量SNP标记的可行性

首先选择139个牛SNP标记, 利用DNA池测序法, 根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值>1/2); 为了进一步验证筛选的准确性, 对其中59个标记采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术检测了122头荷斯坦牛的基因型。结果显示, 检出率高于85%的标记有56个, 其平均最小等位基因频率(Minor allele frequency, MAF)为0.41, 最小值为0.27, 最大值为0.5; MAF>0.3的标记有54个, 占96.4%(54/56)。文章结果表明, 采用DNA池测序法筛选高信息量SNP标记是可行和可信的。     

赤拟谷盗模拟种公畜选择──常规与改进方法的比较

本实验用实验昆虫赤拟谷盗两个世代各３０个家系的８５９和７２６只蛹的２３日龄蛹长和蛹宽作为选择性状模拟种公畜选择,对常规方法和改进方法进行比较。以Ｈｅｎｄｅｒｓｏｎ方法Ⅲ和综合指数作为常规方法,用约束最大似然法（ＲＥＭＬ）和ＢＬＵＰ估计方差组分和育种值为改进方法。结果表明,常规法估计遗传参数在两世代中不稳定,而改进方法弥补此缺点。对两世代个体和家系育种值排队,结果表明两种方法在前几名无差别,说明在选择强度大（留种率低）时,两种方法效果基本一致。     

猪产仔数性状基因效应与有效基因数的研究

利用太湖猪（Ｐ１）、长白猪（Ｐ２）、杂交一代（Ｆ１）、杂交二代（Ｆ２）、杂交三代（Ｆ３）;和回交一代（Ｂ２）等６个世代产仔数的材料,分析了猪产仔性状的基因效应和基因数。结果表明上位效应不显著,猪产仔数性状符合加性－显性遗传模式,受一个有效基因控制。太湖猪产仔数性状基因加性值比长白猪高１．３９头,太湖猪高产仔数基因对长白猪等位基因呈显性,显性度为０．８１。     

结合MOET技术的奶牛标记辅助选择方案比较

应用计算机模拟的方法比较利用遗传标记信息和/或超数排卵和胚胎移植(MOET)技术的一系列奶牛育种方案相对于传统育种方案的优越性. 模拟性状为产奶量, QTL作为已知遗传标记. 8个奶牛育种方案分别是：传统的后裔测定方案用STANPT表示; GASPT方案在青年公牛进入后裔测定前通过其自身QTL基因型进行预选择; MOETPT方案应用MOET技术产生青年公牛, 青年公牛预选择为家系内全同胞随机选择; GAMOPT方案结合了QTL预选择及MOET技术; COMBPT方案在GAMOPT方案基础上, 在个体育种值的评估中加入了QTL基因型效应; 另外对应后裔测定体系中MOETPT,GAMOPT,COMBPT方案设计了3个非后裔测定方案, 分别命名为MOET方案、GAMO方案及COMB方案. 动物个体通过相对应的动物模型进行育种值评估, 模拟针对产奶性状进行重叠世代连续17年的选择. 针对现役公牛、泌乳母牛、公牛母亲、公牛父亲和青年公牛5个不同群体, 对应用QTL信息和MOET技术对有利QTL基因频率、真实育种值、多基因值和累积遗传进展优势率产生的影响进行评估. 结果表明, 结合QTL信息和MOET技术的方案, 其真实育种值遗传进展显著高于其他方案, 仅应用QTL信息或MOET技术的单一改进方案间差异不显著, STANPT方案效率最低. 应用MOET技术的方案在第17年获得的多基因选择反应更大. 不同育种方案有利QTL基因频率增加速度在3个公畜群体中差异远大于泌乳母牛群体. GASPT,MOETPT,GAMOPT,COMBPT,MOET,GAMO 和COMB 方案相对STANPT方案, 累积遗传进展优势率在现役公牛群体中分别为8.42%, 3.59%, 14.58%, 18.54%, 4.12%, 14.12%和16.50%, 在泌乳母牛群体中分别为2.70%, 5.00%, 11.05%, 12.78%, 7.51%, 17.12%和25.38%.     

利用高密度SNP标记分析中国荷斯坦牛基因组近交

畜禽育种中传统上利用系谱信息评估群体近交程度?近年来随着高通量单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism, SNP)检测成本降低,使利用基因组信息分析真实的基因组近交程度成为可能?本研究利用牛54 K SNP 芯片数据统计了北京地区2107头荷斯坦牛基因组上的长纯合片段(runs of homozygosity, ROH)的频率和分布,计算了2种基因组近交系数,即染色体上ROH的长度占基因组总长度的比例(Froh)及个体所有标记基因型中纯合子所占比例,即基因组纯合度(Fhom),进而分析了两种基因组近交系数之间的相关性以及基因组近交与系谱近交系数之间的相关性?结果表明,共检测到44 676个ROH片段,其长度主要分布在1~10 Mb之间?不同长度的ROH散布于个体基因组内,短ROH较长ROH更为常见?ROH在染色体上并非均匀分布,ROH频率最高的区域为10号染色体中部?两种基因组近交系数之间相关性很高(91%以上),但基因组近交与系谱近交之间的相关性较低(低于50%)?系谱完整性是影响基因组近交与系谱近交结果一致的重要因素,基因组近交系数能够反映个体真实的近交,本研究为评估群体近交水平提供了有力工具?     

中国荷斯坦牛CVM的基因检测及其与产奶性状的关联分析

脊椎畸形综合征(Complex vertebral malformation, CVM)是由位于牛第3号染色体(BTA3)的SLC35A3基因外显子4的一个单碱基突变(G559T)所致。该致病基因在世界许多国家的荷斯坦牛群中都有一定的比例。文章对北京地区38头优秀种公牛进行分析, 发现了4头携带者, 进而检测了这些携带者公牛的555头女儿的基因型, 其中携带者占检测母牛数的44.0%。此外, 关联分析结果表明, 携带者母牛与非携带者母牛的生产性能之间存在显著差异(P<0.01)。携带者母牛的5个产奶性状育种值均显著高于非携带者, 泌乳持续力和体细胞评分SCS的育种值也比非携带者略高。CVM致病基因可能与BTA3上影响产奶性状的QTL或基因连锁。因此, 建议生产中对CVM携带者进行逐步淘汰