生物信息学对番茄LeNHX1基因的研究

应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX1蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析.结果表明此蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个保守的氨氯吡嗪咪结合位点LFFIYVLPPI区域,相对分子量为59.0 kD,等电点为6.60,存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,功能分类和蛋白质同源性分析表明番茄LeNHX1属于液泡膜Na+/H+反向转运蛋白.     

番茄LeABI3基因的生物信息学分析

对所克隆到的番茄LeABI3基因测序结果进行序列分析,发现得到LeABI3基因的2种转录本.应用生物信息学的方法和工具对LeABI3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域和同源树进行分析,结果表明此蛋白是包含一个保守B3结构功能域的亲水性不稳定蛋白,相对分子量为65.4 kD,等电点为6.54,可能存在2个跨膜区域.蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,蛋白质同源分析发现番茄LeABI3和马铃薯vp1-ABI3类蛋白相似度最高,同源性为89%.     

一种经济、简便和准确鉴定重组质粒的方法

目的：提高重组质粒的筛选效率,探讨一种经济、快速并准确的重组质粒鉴定方法。方法：取200μl菌液于Eppendorf管中高速离心1min,倒出上清,沉淀中加入20μl裂解缓冲液以裂解细胞并释放出内部质粒,10000r/min离心10min后取5～10μl上清液进行琼脂糖凝胶电泳,并比较其迁移位置来以判断重组质粒。结果：该方法鉴定结果和PCR鉴定结果完全一致。结论：该方法具有成本低廉、简便快速的特点,在对大量样品进行鉴定时具明显优势,适合在常规实验室推广。     

草地藏系绵羊乳游离氨基酸质量分数及蛋白遗传多态性研究

用反相高效液相色谱法检测草地藏系绵羊乳游离氨基酸质量分数,用聚丙烯酰胺凝胶电泳法研究乳蛋白组分及其遗传多态性。结果表明:草地藏系绵羊乳中检测到17种游离氨基酸,其中质量分数最高的为Arg;与金堂黑山羊乳比较17种游离氨基酸中,甲硫氨酸的质量分数极显著高于金堂黑山羊(p<0.01),而天冬氨酸、甘氨酸、赖氨酸、谷氨酸、苏氨酸、丙氨酸和缬氨酸的质量分数均显著低于金堂黑山羊(p<0.05),其余9种游离氨基酸质量分数未发现明显差异,但两种羊乳中的必需氨基酸总量基本相同,差异不明显(p>0.05)。草地藏系绵羊乳蛋白组分主要包括α-La、β-Lg、CN、IgG等,CN的相对质量分数约50%~52%;研究还发现4种分子量类型的乳上皮粘蛋白MUC1,分子量分别为214kD、209kD、207kD、205kD;CN、β-Lg均未检测到多态性,说明草地藏系绵羊乳蛋白遗传多态性较为贫乏。     

不同种群密度地区长足大竹象生殖系统的超微结构研究

长足大竹象Cyrtotrachelus buqueti是竹林的毁灭性害虫,但四川省乐山市和贵州省赤水市相距不足300 km,其种群密度却相差48倍。生殖是维持昆虫种群密度的关键环节之一。本文应用形态解剖及扫描电镜技术,系统比较了乐山、赤水两地长足大竹象成虫生殖系统的形态特征和超微结构差异,旨在探究两地种群差异的原因。结果显示,成虫生殖系统形态结构、外生殖器超微结构未观察到显著差异;赤水地区雌虫卵黄颗粒表面粗糙有镂空,直径显著小于乐山地区,雄虫睾丸内壁粗糙有褶皱,精细胞直径极显著小于乐山地区,每万立方微米内精细胞的数量超过乐山地区2倍。精细胞和卵细胞结构、大小的变化可能是两地长足大竹象种群数量差异显著的直接原因。本文结果对研究长足大竹象种群变化、种群发生等具有现实参考价值。     

长足大竹象生殖系统的形态解剖研究

解剖研究了长足大竹象雌雄虫牛殖系统的构造.该虫的雌性生殖系统包括一对卵巢、一对侧输卵管、中输卵管、交配囊、受精囊、生殖腔、产卵器;雄性生殖系统由一对睾九、一对输精管、一对附腺、射精管和交配器组成.     

番茄LeNHX1基因植物过量表达载体的构建及表达分析

从番茄幼苗中提取RNA,根据NCBI中番茄LeNHX1基因序列设计引物,通过RT-PCR获得了番茄LeNHX1基因的cDNA序列,包含一个1 605 bp的开放阅读框,编码534个氨基酸。将cDNA序列连接到植物过量表达载体PBI121上,对所获得的重组质粒进行双酶切鉴定,结果表明,植物过量表达载体PBI121-LeNHX1已构建成功。半定量RT-PCR结果表明LeNHX1基因在根、茎和叶中均表达,盐、低温和脱落酸的诱导能提高LeNHX1基因的表达量,推测番茄LeNHX1基因在逆境应答中可能起着重要作用。     

藏绵羊β-乳球蛋白的基因克隆及多态性检测

目的：对藏绵羊β-乳球蛋白（β-Lg）基因序列进行克隆和多态性分析,为藏绵羊资源的利用提供依据。方法：提取基因组DNA,采用PCR方法克隆β-Lg部分基因序列;分别利用PCR-RFLP和高效液相色谱法检测β-Lg基因和蛋白多态性。结果：藏绵羊β-Lg与普通绵羊类似,存在A、B两种遗传变异体,A变异体的基因频率为0.818（n=22）;HPLC能很好地分离β-Lg的A、B两种遗传变异体,A的表型频率分别为0.700;β-Lg为杂合型的藏绵羊中,大多数个体乳中的A变异体表达量低于B变异体。结论：藏绵羊β-Lg基因与普通绵羊存在一些差异,有两种变异体,并且其在乳中的相对表达量不同。