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免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究 总被引:11,自引:4,他引:7
应用免培养法(Cultureindependent)对云南腾冲热海大滚锅高温热泉中细菌的多样性进行初步的分析。经过克隆筛选,测定了5个克隆的16S rDNA插入片段的近全序列,系统发育分析的结果表明,它们分属于Bacillus、Hydrogenobacter和Pseudomonas,有一个克隆尚难确定其分类地位,它属于Thermodesulfobacteriaceae科,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfobacteria属之间。经PCR扩增出上述5个克隆16S rDNA插入序列中及环境样品总DNA中的16S rDNA V8高变区约600bp片段,进行变性梯度电泳(DGGE)。所得电泳图谱和5个序列的系统发育树不仅表明该高温热泉存在着丰富的细菌多样性,还显示了它们是该高温热泉中细菌的优势物种。 相似文献
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几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较 总被引:6,自引:0,他引:6
用酶解法,化学裂解法和微波炉法,冻融法等物理裂解方法组合出5种方法直接从滇西一个高温热泉沉积物提取DNA。经常规的琼脂糖凝胶电泳检测,发现用溶菌酶,蛋白酶K酶解,SDS化学裂解结合微波炉法裂解不仅可以得到较大量的DNA。而且碎片段较少,提取出来的DNA经RNA酶和蛋白酶K处理后可直接进行PCR扩增。同时DGGE(变性梯度凝胶电泳)电泳检测,结果表明,此法不仅可以得到该种环境中较多微生物分类单位的DNA,而且还能够较好地体现出它们在量上的差异。 相似文献
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滇西热泉中9个16SrDNA克隆的分析 总被引:4,自引:0,他引:4
用免培养法(Culture-independent approach)从腾冲大滚锅和龙陵大沸泉两个高温热泉中获得的16SrDNA,经克隆筛选,测定了其中9个克隆的16SrDNA插入片段的近全序列,构建系统发育树进行分析。结果表明,9个克隆中有4个是Thermus属、2个是Bacillus属、1个是Hydrogenobaeter属、1个是Pseudomonas属,还有1个在Themmdemtlfohacteriaceae科,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfobacteria属之间。 相似文献
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