钩端螺旋体LA_1100蛋白膜定位研究

目的 研究LA_1100蛋白在钩端螺旋体中的膜定位并分析其在中国流行血清群中的保守性.方法 利用生物信息学软件对LA_1100的二级及三级结构进行分析,以Triton X-114抽提分离钩体细胞的各个组分,Westernblot及FACS方法验证LA_1100在钩端螺旋体中的膜定位.Western Blot和PCR在蛋白水平及核酸水平检测了其在13个中国流行血清群代表株中的保守性.结果 LA_1100的二级结构显示具有α-螺旋及β-折叠结构,进一步分析表明,此蛋白具有跨膜区.LA_1100单体结构具有典型的TolC结构域,三级结构模拟显示三聚体可形成孔状结构.膜定位显示,该蛋白定位于外膜.该基因的保守性分析结果表明,在中国13个流行代表株中有12株均检出该基因或该蛋白的特征性条带.结论 LA_1100为具有TolC结构域可以形成孔状结构的钩端螺旋体外膜蛋白,在中国流行株钩端螺旋体中保守.由于TolC蛋白与病原菌分泌致病因子密切相关,推测此蛋白可能与钩体感染宿主时粘附及致病相关,进一步对此蛋白进行研究有利于揭示钩体的致病机制.     

问号钩体粘附侵袭相关基因特征分析

使用NCBI ,Swissprot/TrEMBL ,ProDom ,Pfam ,Tmpred ,SignalP ,ClustW等网络资源和软件 ,根据问号钩体黄疸出血型赖株粘附侵袭相关基因诠释结果 ,对mce ,invA ,mviN和atsE四个粘附侵袭相关基因编码蛋白的结构域、跨膜区域和信号肽等进行了详细分析 ,并使用Bioedit,Mega2软件进行氨基酸多重序列比较并绘制系统发生树。结果显示 ,mce和mviN为穿膜蛋白 ,invA和atsE为菌体内蛋白质 ;许多对哺乳动物和对植物致病的微生物具有mce ,invA ,mviN和atsE四个粘附侵袭相关基因 ,其表达的蛋白质在感染宿主过程中起重要作用 ,钩体的粘附侵袭相关蛋白与它们在一级结构上有较高相似性。据生物信息学结果推测 ,问号钩体黄疸出血型赖株粘附侵袭相关基因和钩体致病性间有密切关系 ,其编码蛋白在致病过程中可能起重要作用     

含油脂废水中一株栗褐芽胞杆菌的筛选和鉴定

目的从含油脂废水中筛选鉴定出油脂降解菌。方法从含油脂废水中取样,通过分离、培养,筛选出以油脂为唯一碳源和能源并能分解油脂的菌株,对其基因组16S DNA测序,在核酸数据库中进行BLAST比对,并进行生化反应,进行菌种的鉴定。结果从含油脂废水中筛选出8株微生物,最终筛选出1株油脂降解菌,鉴定为栗褐芽胞杆菌。结论从含油脂废水中筛选出1株栗褐芽胞杆菌,为下一步实验证实其分解油脂的作用和机制奠定了基础。     

问号钩端螺旋体疫苗候选基因LB061的抗原性和保守性研究

目的 克隆表达和鉴定问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株中疫苗候选基因LB061,研究LB061的免疫原性和在不同血清型钩端螺旋体菌中的保守性。方法 生物信息学软件分析预测LB061的特征。构建原核表达质粒pQE31-LB061,经IPTG诱导后用SDS-PAGE及Western印迹法鉴定表达情况。用表达的重组蛋白免疫BALB/c小鼠,Western印迹法检测其抗原性和在不同血清型钩端螺旋体中的保守性。Western印迹法检测钩端螺旋体全菌兔抗血清中的LB061抗体。结果 生物信息学预测结果显示,LB061含有DUF839家族结构域。成功克隆了重组质粒pQE31-LB061,表达的重组蛋白能刺激BALB/c小鼠产生抗体(效价为1∶32000),并能与相应抗体反应,具有良好的抗原性。在16株不同血清型的钩端螺旋体中均可检测到LB061蛋白的表达,并在钩端螺旋体赖株全菌兔抗血清中检测到其抗体。结论 LB061蛋白可以作为外膜蛋白刺激宿主免疫系统产生抗体,具有良好的抗原性和保守性。本研究为其作为疫苗候选基因的研究奠定了基础。     

问号钩端螺旋体中一个新的OmpA家族蛋白抗原性及保守性研究

目的克隆表达和鉴定问号钩端螺旋体(L.interrogans)黄疸出血群赖型赖株中一个新的外膜蛋白(Omp)A家族基因LA0301,研究LA0301编码蛋白的抗原性和在15个钩端螺旋体(简称钩体)血清群代表株中的保守性,探讨其在疫苗研究中的意义。方法生物信息学软件分析预测LA0301的特征。构建原核表达重组体pQE31-LA0301,经IPTG诱导后用十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)及蛋白质印迹法(Western blot)鉴定表达情况。用表达的重组蛋白免疫BALB/c小鼠,Western印迹检测其免疫反应性和在不同血清型钩体中的保守性。酶联免疫吸附试验(ELISA)和Western印迹检测兔抗钩体全菌血清中的LA0301编码蛋白的抗体。结果生物信息学预测结果显示,LA0301具有OmpA家族的结构域。克隆表达了重组质粒pQE31-LA0301,重组蛋白能刺激BALB/c小鼠产生特异性抗体,效价为1:32000。在兔抗钩体全菌血清中检测到特异的LA0301蛋白抗体,并在15个血清群的代表株钩体中均可检测到LA0301蛋白。结论LA0301蛋白是问号钩体中一个新的OmpA家族蛋白,具有良好的抗原性和保守性,并且能在钩体感染的过程中刺激机体产生相应的抗体。为进一步研究钩体新型疫苗候选基因奠定了基础。