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1.
目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群用454高通量方法获得16S rRNA基因的V3区的测序数据,用CVTree的方法进行菌群结构的比较分析。结果通过选取合适的短串长度,CVTree的方法能准确检测到各样本间的聚类关系,其结果与之前文献报道的基于Unifrac算法的结果相一致。结论CVTree能快速、有效地处理16S rRNA基因的454高通量测序数据,实现对不同菌群结构相似性的比较分析。  相似文献   
2.
目的比较2种粪便保存方法(室温法和Invitek公司的粪便稳定剂保存法)对菌群结构研究的影响。方法应用PCR-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)方法,对用2种方法保存的3位志愿者粪便样品进行菌群结构的分析。结果室温法保存粪便样品24h后,S1个体菌群结构与原始样品的菌群结构相似度为83%,S2和S3的菌群结构与其原始样品的相似度仅为77%。而使用粪便稳定剂保存1d,期间各时间点样品菌群结构与原始样品相比变化较小,相似度在80%-90%。结论粪便稳定剂具有一定的稳定样品菌群结构的作用,在新鲜粪佰样品不能寺刻讲行深冻的情况下,使用粪便稳定剂是一种较好的样品保存方法。  相似文献   
3.
克隆出茶树咖啡碱合成酶基因,对其进行原核表达,并制备TCS1抗体,旨在从蛋白水平研究茶树体内TCS1的表达情况。根据Gen Bank登陆的TCS1基因的全长c DNA序列,找出其完整的ORF(开放阅读框),从茶树叶片c DNA中克隆了TCS1基因的开放阅读框,连接到p GEX-4T-2表达载体,经IPTG诱导表达重组蛋白p GEX-4T-2-TCS1。进行体外酶活检测后,亲和层析纯化重组蛋白,作为抗原免疫家兔,制备TCS1多克隆抗体。用ELISA方法检测抗体效价,Western blot检测抗体的特异性。通过优化诱导条件,得出重组蛋白的最佳表达条件为:30℃、4 h。诱导后的总蛋白、可溶性蛋白与包涵体蛋白均出现一条明显的外源蛋白条带。抗体经ELISA检测,效价为1∶2 000,Western blot检测表明抗体具有相对较好的特异性。构建了TCS1原核表达质粒,同时成功制备了抗TCS1的多克隆抗体。  相似文献   
4.
以五分地沟试验区为例,利用IKONOS卫星遥感图像,结合DEM,对地形复杂的黄土丘陵地区制作植被图,并进行三维显示,直观地表达了研究区域植被的空间分布。使用景观指数,分析了植被空间格局的特点。结果表明,试验区整体格局较破碎,但斑块稳定性较好,分维数为1.25。人工植被占主导地位,人工乔木林和农田成为基质,天然植被、水体等类型以小斑块的形式镶嵌其中。经过综合治理,当前的植被结构和空间布局能有利于控制试验区的水土流失。研究表明,高空间分辨率数据对于地形复杂的沟壑丘陵地区制作植被图及进行综合分析具有明显的优势。  相似文献   
5.
摘要 目的:探讨自适应性生物反馈训练(ABF)对出口梗阻型便秘(OOC)患者肛肠动力学、胃肠激素水平及负性情绪的影响。方法:选取2021年6月~2022年12月江苏省中医院收治的104例OOC患者作为研究对象,按照随机数字表法分为观察组、对照组各52例。对照组采用固定式生物反馈训练(FBF)治疗,观察组采用ABF治疗。比较两组临床疗效、治疗前后便秘症状评分、肛肠动力学指标(直肠肛门压力梯度、直肠初始感觉阈值及直肠排便感觉阈值)、胃肠激素[P物质(SP)、胃动素(MTL)、胃泌素(GAS)]水平及负性情绪[汉密尔顿焦虑量表(HAMA)与汉密尔顿抑郁量表(HAMD)]。结果:治疗后两组各项便秘症状评分和总评分均低于治疗前,且观察组低于对照组(P<0.05)。观察组总有效率96.15%高于对照组82.69%(P<0.05)。治疗后两组直肠肛门压力梯度高于治疗前,且观察组高于对照组;两组直肠初始感觉阈值及直肠排便感觉阈值低于治疗前,且观察组低于对照组(P<0.05)。治疗后两组血清SP、MTL、GAS水平高于治疗前,且观察组高于对照组(P<0.05)。治疗后两组HAMA、HAMD评分低于治疗前,且观察组低于对照组(P<0.05)。结论:ABF可有效改善OOC患者临床症状、肛肠动力学、胃肠激素水平及负性情绪,提高临床疗效,值得临床推广应用。  相似文献   
6.
森林生态系中球孢白僵菌遗传多样性的ISSR分析   总被引:8,自引:0,他引:8  
李旻  王四宝  樊美珍  李增智  黄勇平 《遗传》2006,28(8):977-983
应用ISSR分子标记对安徽大别山区的球孢白僵菌遗传多样性进行了研究。从33个引物中筛选出12个多态性高、稳定性好的ISSRs用于正式的扩增分析,在2个自然保护区、3个不同季节和3个不同海拔梯度采集的48个菌株中共扩增出84条带,其中73条为多态性条带,多态性为81%,平均每个引物扩增出7条(2~11)。群体的多态位点百分率(PPL)达81%,Nei’s基因多样性(H)为0.3187,Shannon信息指数(I)为 0.4782。居群间的基因分化系数较小(Gst)0.1028。以上结果表明:安徽大别山区球孢白僵菌有较高的遗传多样性, 居群间遗传变异较小,居群内表现出较高水平的遗传分化。  相似文献   
7.
目的建立能快速筛查和比较大规模人群肠道中柔嫩梭菌类群组成结构的T-RFLP(末端限制性片段长度多态性)。方法采用T-RFLP技术特异性地分析柔嫩梭菌类群的组成,考察该方法的重复性和灵敏度。用该方法对15个志愿者肠道中的柔嫩梭菌类群进行分析,并与DGGE方法分析的结果进行对比。结果T-RFLP方法重复性高,最低能检测到群落中1%的细菌,其结果与DGGE的分析结果具有较好的一致性。结论本研究建立的柔嫩梭菌类群特异性的T-RFLP方法能够对大量肠道样品中柔嫩梭菌类群的结构进行快速、有效的筛查和比较。  相似文献   
8.
对云南山茶 (Camellia reticulata) 8个品种的核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序,将获得的ITS序列进行GC含量、 5.8S区二级结构的稳定性、替代模式、核苷酸多样性及系统发育关系的相关分析.实验结果显示,云南山茶8个品种的ITS序列存在丰富的基因组内多态性,同时包含中性进化的假基因,表明其ITS序列逃离了一致性进化.云南山茶ITS序列多态性的原因可能来自广泛的种间杂交,以及rDNA位点在基因组中有不确定的物理位置.ITS假基因为品种的物种形成研究提供了更全面的遗传证据,同时也提示了利用ITS假基因进行系统发育分析可能会对其真实的系统关系造成影响.  相似文献   
9.
类甜蛋白的结构特征以及功能研究进展   总被引:3,自引:1,他引:2  
类甜蛋白是一种具有多种生物学活性及重要功能的植物防御蛋白,属于病程相关蛋白。近年来关于类甜蛋白具有抗真菌活性的研究较多。类甜蛋白具有葡聚糖酶活性,能结合并降解真菌细胞壁的组成成分—β-1,3葡聚糖酶。在三维晶体结构中类甜蛋白表面的一个酸性“V”字形裂缝对其抗真菌活性起着至关重要的作用。对类甜蛋白结构与功能的关系,不同植物中类甜蛋白的生物学特性,以及国内外基因工程中类甜蛋白基因的应用研究进展进行了综述。  相似文献   
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