蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测研究进展

蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能,因此蛋白质的功能与其亚细胞定位有着密切的联系,通过确定蛋白质在细胞中的位置可以获取蛋白质功能和结构的信息。在近二十年中,蛋白质亚细胞定位预测算法研究已经取得很大的成绩,在此基础上,蛋白质在细胞器内亚结构的定位预测研究,如对蛋白质亚线粒体和亚叶绿体定位的研究成为更深层次的问题,本文简要介绍国内外在蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测方面的研究进展。     

蛋白质亚细胞定位的识别

根据蛋白质的亚细胞定位,将蛋白质分为12类,用离散量的数学理论,以蛋白质中400个氨基酸二联体数目构成离散源,通过计算离散增量预测蛋白质的亚细胞定位,用Self-consistency和Jackknife两种方法测试均获得较高的预测成功率。结果表明：Self-consistency方法预测成功率为84．5％,Jackknife方法预测成功率为81．1％。     

革兰氏阳性菌蛋白结构域特征分析

结构域是蛋白质序列中具有独特功能的区域,这些区域影响着蛋白质的功能,因此研究结构域的特征对于了解蛋白质功能很有帮助。构建革兰氏阳性菌蛋白质4个亚细胞位置数据集,对该数据集中的蛋白质进行结构域的搜索和功能分析,找到了革兰氏阳性菌的细胞壁、细胞质、细胞膜和细胞外四个蛋白质区域的结构域。分析这四个位置结构域的功能并在PDBsum数据库中找到了这些结构域的二级结构和三级结构图,利用这些特征信息可以更深入的了解革兰氏阳性菌蛋白质的结构和功能。     

基于支持向量机识别亚高尔基体蛋白质的定位

研究表明,许多神经退行性疾病都与蛋白质在高尔基体中的定位有关,因此,正确识别亚高尔基体蛋白质对相关疾病药物的研制有一定帮助,本文建立了两类亚高尔基体蛋白质数据集,提取了氨基酸组分信息、联合三联体信息、平均化学位移、基因本体注释信息等特征信息,利用支持向量机算法进行预测,基于5-折交叉检验下总体预测成功率为87.43%。     

四乙铵对缺氧时海马脑片诱发电位的影响

四乙铵对缺氧时海马脑片诱发电位的影响李凤敏徐淑梅沙日娜１（天津医科大学生理教研室,天津３０００７０,天津职工医学院生理教研室,天津３０００５２）海马脑片缺氧后,ＣＡ１区锥体神经元诱发群锋电位（ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｐｉｋｅ,ＰＳ）呈现出一个特征性的时...     

低温高效苯酚降解菌的分离与降解特性

从哈尔滨太平污水厂活性污泥中筛选到7株高效苯酚降解菌,可利用苯酚作为唯一碳源和能源。通过对这7株菌在不同温度、pH值、以及不同苯酚浓度下生长和苯酚降解情况的考察,确定了这7株菌的最适生长温度为10°C,最适pH值为7.5,最大可降解苯酚浓度为3000mg/L。通过对这7株苯酚降解菌降解性能的研究表明:其具有较强的苯酚降解能力,在10°C、pH值为7.5、装液量为50mL、接种量15%、摇床振荡速度160r/min的条件下,反应48h后可使500mg/L的苯酚降解率达90%以上。葡萄糖对菌体的生长及苯酚降解能力均有一定的影响,当葡萄糖浓度是500mg/L时,该菌对苯酚的降解率仍在80%以上。该研究对处理含有其它碳源的含酚废水具有一定的意义。通过DGGE图谱条带的分析表明,其亮度可以说明这些菌在各个系统中均表现为优势菌,且在污水环境中表现出较强的活性,其优势地位能够稳定地存在。其中2、4、24、28条带丰富,表现出它们在污水环境系统中的多样性。     

低温高效油脂降解菌的分离筛选驯化

在我国北方地区冬季水温偏低, 低温是造成寒冷地区冬季含油脂污水处理效果差的主要原因。当温度降低至4°C左右时, 污水的生物处理普遍存在着处理效果差, 出水难以达标的问题。而微生物法是处理油脂污染物的一种最有效、最安全和最彻底的方法。因此本文从微生物学角度对此进行了研究, 从自然界中分离、筛选到了8 株能在5°C下生长并能降解生活污水中油脂的低温菌。