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1.
从大规模癌样本基因突变扫查数据中识别癌基因具有重要的意义. 一些重要功能的改变对于癌的发生发展是必需的, 因此将它们定义为癌功能类, 并从GO(Gene Ontology)中选择一组显著富集已知癌基因的细致功能类来代表它们. 为了评价以癌相关功能类作为特征识别癌基因的效果, 将已知的蛋白激酶癌基因定义为阳性金标准, 而将其他的蛋白激酶基因定义为阴性金标准. 结果表明, 与利用选择压力作为特征的方法比较, 利用癌相关功能类作为特征的方法可以更有效地识别癌基因. 进一步结合癌相关功能类与基因非同义突变个数可以产生更可靠的预测结果. 最后, 将46个注释到癌相关功能类并且其非同义突变个数至少为3的蛋白激酶基因预测为癌基因, 预测精确率达到0.42.  相似文献   
2.
研究了一类被感染细胞具有潜伏和活性两阶段以及免疫反应的病毒动力学模型.通过建立适当的Lyapunov泛函和使用LaSalle不变集原理,获得当σ≤1,ω≤1σ和σω1时,对应的未感染平衡点P,体液免疫未激活的无免疫感染平衡点M,体液免疫已激活的感染平衡点N是全局渐近稳定的充分条件.所获得结果推广了Nowak(1996)和Bangham(1997)的工作,得到了一些新结果.  相似文献   
3.
4.
分娩期是妇女一生中最特殊的时期,十月怀胎,一朝分娩,既是人类繁衍的自然规律,又是产妇痛并快乐着的事。产程中产妇会产生不同程度的焦虑、恐惧、紧张、疑虑等心理反应,尤其是初产妇由于对于分娩知识的缺乏,本身没有经验,更容易产生这些心理;所以在产程中产妇的心理护理是围分娩期护理工作中的重点,只有通过有效的心理护理,取得产妇的信赖与配合,使之顺利经阴道分娩,可有效降低难产率和剖宫产率[1]。  相似文献   
5.
采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系.根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类.通过对比原始多类标签,采用聚类评估指标来分析两类化聚类结果的效果,并探讨特征功能模块与疾病异质性之间的关系.实验结果显示:在两套不同的白血病基因表达谱数据中得到的特征功能模块类似,它们对白血病亚型有较强的分型能力.  相似文献   
6.
目的建立检测人体粪便提取液对肠上皮细胞毒性的方法。方法以Caco-2细胞为体外模型,应用建立好的毒性检测方法:用MTT法(四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色法)检测细胞毒性,用单细胞凝胶电泳技术检测遗传毒性,对糖尿患者和健康人的粪便提取液进行分析。结果糖尿病患者粪便提取液的细胞毒性显著高于健康人(n=30,P〈0.05);其遗传毒性显著高于阴性对照PBS(P〈0.05),与健康人相比有升高趋势,但差异无统计学意义。结论粪便提取液的毒性检测方法可以简便、有效地检测人体粪便中毒性物质对肠上皮细胞的影响,因此可作为评价肠道菌群状态的方法。  相似文献   
7.
以纯化的病毒抗原加完全福氏佐剂,免疫BALB/c小鼠,再利用杂交瘤技术建立针对汉坦病毒、狂犬病毒及乙型脑炎病毒的单克隆抗体(McAb)细胞株,制备并提纯标记McAb,应用于各种实验和检测工作。结果获得了6株分泌抗汉坦病毒McAb杂交瘤细胞株、6株分泌抗狂犬病毒McAb杂交瘤细胞株、2株分泌抗乙型脑炎病毒McAb杂交瘤细胞株,共14株,并对它们的特性进行了分析。各McAb效价不尽相同,有的高达10-7,有的则不足10-3。各McAb亚型以IgG型为主,少数为IgM型;轻链以κ型为主,个别为λ型或阴性。McAb与纯化的病毒抗原有明显的特异性吸附(P<0.01)。有的McAb有相同的作用位点,有的McAb则没有,但与其它McAb有交叉反应。通过对McAb进行提纯和标记,建立了双抗体夹心ELISA法,用于病毒抗原的检测。实验表明获得的McAb有较好的生物学特性,可与相应的病毒抗原特异性结合,用于免疫学检测及其它多种用途。  相似文献   
8.
根据蛋白质互作网络预测乳腺癌相关蛋白质的细致功能   总被引:1,自引:0,他引:1  
王靖  李彦辉  郭政  朱晶  马文财  彭春方  刘庆 《遗传》2007,29(9):1061-1066
乳腺癌是最为常见的恶性肿瘤之一。已有的关于乳腺癌相关蛋白质的功能注释比较宽泛, 制约了乳腺癌的后续研究工作。对于已知部分功能的乳腺癌相关蛋白质, 提出了一种结合Gene Ontology功能先验知识和蛋白质互作的方法, 通过构建功能特异的局部相互作用网络来预测乳腺癌相关蛋白质的细致功能。结果显示该方法能够以很高的精确率为乳腺癌相关蛋白质预测更为精细的功能。预测的相关蛋白质的功能对于指导实验研究乳腺癌的分子机制具有重要的价值。  相似文献   
9.
张杨  沈晓沛  王靖  朱晶  郭政 《生物信息学》2011,9(3):217-219,223
癌是一种涉及多基因变异的遗传异质性疾病,涉及多种生物学功能通路中不同基因的遗传变异。因此,识别癌基因是一项富有挑战性的工作。提出通过寻找在癌样本中突变显著共发生的基因筛选候选癌基因的方法。应用该方法,通过分析蛋白激酶基因在癌组织中的突变谱数据,发现了167个显著共发生突变的基因对,包含85个基因。分析这167个基因对发现:(1)发生共突变的基因富集已知的癌基因;(2)共突变基因对倾向于共扰动与癌症相关的通路对。以上结果提示,在癌样本中显著共发生突变的基因倾向于候选癌基因;在癌发生过程中起重要作用的基因倾向于协同扰动不同的癌相关细胞生物学过程。  相似文献   
10.
迁徙停歇期鸻鹬类在崇明东滩潮间带的食物分布   总被引:1,自引:0,他引:1  
朱晶  敬凯  干晓静  马志军 《生态学报》2007,27(6):2149-2159
崇明东滩是鸻鹬类在东亚-澳大利西亚迁徙路线上重要的迁徙停歇地,滩涂上的底栖动物为迁徙的候鸟提供了丰富的食物来源。采用圆筒取样法对崇明东滩潮间带的大型底栖动物群落进行了研究。研究表明,该区域的大型底栖动物主要有腹足类、双壳类、甲壳类、多毛类环节动物及昆虫幼虫等类群。其中以腹足类密度最高((2805±360)个/m^2),约占底栖动物总密度的80%。其次为双壳类,密度为(320±31)个/m^2。双壳类的生物量(湿重)为(51.4±7.8)g/m^2,腹足类(38.7±5.1)g/m^2,两者占底栖动物总生物量的90%以上。不同类群的底栖动物在潮间带的空间分布上有显著差异。腹足类主要分布在海三棱藨草带,双壳类在海三棱藨草外带至光滩区域分布较多。从空间分布来看,腹足类在崇明东滩的北部区域分布较多,在南部区域则明显减少。双壳类在南北各条样线上的平均密度没有显著差异。除双壳类在秋季迁徙期的密度高于春季迁徙期外(P〈0.001),其他类群的底栖动物在春季和秋季迁徙期的密度均无显著差异(P〉0.05)。  相似文献   
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