肝细胞生长因子Kringle的三维结构模建及与功能的关系

利用同源模建的方法模拟得到了肝细胞生长因子4个Kringle域的三维结构。结果表明,HGFKringle与纤溶酶原Kringle的氨基酸序列具有较高的同源性,其功能区附近的序列比较保守。HGF的Kringlel和3与其它具有Lys结合功能的Kringle相比,功能区的残基发生了变化,可能丧失了结合Lys的功能,而2和4仍具有一定的该功能。根据Kringle 1的模建结构,推测该Kringle功能区的结构为一个通道,该通道的底部和一侧有部分疏水残基,同时两侧还分布着少量酸性或碱性残基,该通道可能具有结合特定肽链的功能,从而与Kringle 2一起实现HGF与受体结合的作用。     

序列同源性比较软件Blast的本地化实现及VB接口程序的编制

美国国家生物技术信息中心（ＮａｔｉｏｎａｌＣｅｎｔｅｒｆｏｒＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ,ＮＣＢＩ）的Ｂｌａｓｔ软件是进行核酸序列和蛋白质序列同源性比较的有力工具［１,２］．通过访问ＮＣＢＩ的主页（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）进行Ｂｌａｓｔ同源性比较是常用的分析方法．然而在很多场合需要在脱机状态下使用Ｂｌａｓｔ进行同源性比较,所以,Ｂｌａｓｔ软件的本地化实现有其必要性．本文介绍实现Ｂｌａｓｔ本地化过程的经验,同时用ＶｉｓｕａｌＢａｓｉｃ５．０（以下…     

基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用

基于PC机和Linux操作系统, 利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件, 构建了核酸序列大规模自动分析系统. 该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析, 可加速对大规模测序数据的分析和利用.     

野生香料排草资源调查报告

随着人们物质文化生活的提高,对香料精的需求量越来越大,香料香精的产品越来越多,广泛应用于日用化工、食品、饮料、化妆品、医药、工农业等产品的定香、增香以及祛臭、净化空气,室内消毒,调节空气等。由思茅地区中草医药研究所研制提取的排草香精,经测试评香鉴定认为是一种天然的多用途香料,为使这一成果得到广泛应用,我们对思茅地区及西双版纳州的排草资源进行了全面调查。排草是报春科珍珠莱属植物(Iysimachia microcarpa Hand-Mazz.)近年来我所在开发思茅地区植物资源和发掘民族民间中草药研究中,民间常用于治疗感冒、咳嗽、急、慢性气     

黄河流域生态保护和高质量发展的EKC检验

黄河流域生态保护和高质量发展是国家重大发展战略。运用黄河流域29个市2007-2017年的面板数据，对黄河流域生态保护和高质量发展的关系进行了EKC检验。结果显示，流域内污水处理厂集中处理率和生活垃圾无害化处理率的EKC曲线呈"N"型，一般工业固体废物综合利用率的EKC曲线呈"倒U"型，工业废水排放量和工业SO₂排放量的EKC曲线呈"倒N"型。黄河流域生态保护的人均GDP拐点出现在11.8-14.4万元/人，截止到2017年，各市均未跨过第一拐点，由此可见，该区域生态保护力度及经济高质量发展水平均有待提升。政府部门应继续加大生态保护力度，防止出现污染排放与经济共同增长的现象；同时，应促进人口集聚和发展服务业以抑制生态污染排放并提高污染处理率。     

人EEN蛋白的结构预测和功能分析

采用基于神经网络的算法预测了我们自行克隆的新的白血病相关蛋白ＥＥＮ（ｅｘｔｒａ ｅｌｅｖｅｎｎｉｎｅｔｅｅｎ, ＥＥＮ）全长分子的二级结构,结果表明：ＥＥＮ 蛋白可能有三个结构域,Ｎ 端由三段α螺旋和短β折叠组成,中间为四段α螺旋组成的四螺旋结构,Ｃ端为ＳＨ３结构域,类似于在受体酪氨酸激酶信号传导途径中起重要作用的ＳＥＭ－５／ＧＲＢ２ Ｃ端ＳＨ３结构域;利用同源蛋白结构模拟的方法,模拟了ＥＥＮ ＳＨ３结构域的三维结构,结果表明：ＥＥＮ ＳＨ３结构域与ＳＥＭ－５／ＧＲＢ２ ＳＨ３结构域具有相近的结构,构成脯氨酸结合区的氨基酸非常保守．上述结果提示：ＥＥＮ 蛋白可能为新的信号蛋白,可能涉及新的信号传导途径或新的信号传导旁路,ＳＨ３结构域是其功能区域．