中国5个地方牦牛品种遗传多样性的微卫星分析

本文以大额牛（Bos frontalis）为外群,应用16对微卫星DNA标记结合荧光-多重PCR技术,评估了5个中国地方牦牛（Bos grunniens）（帕里牦牛、斯布牦牛、西藏高山牦牛、麦洼牦牛和九龙牦牛）品种内遗传变异和品种间遗传关系。6个群体的16个微卫星座位上共检测到159个等位基因,其中有33个等位基因为5个牦牛品种所特有。6个群体的有效等位基因数（Ne）在2.2043-3.2754之间,平均杂合度（H）在0.4858-0.6153之间,平均多态信息含量（PIC）在0.4230-0.5711之间。5个牦牛品种的微卫星座位有丰富的遗传多样性;而大额牛的遗传多样性相对较贫乏。5个牦牛群体间的遗传分化系数（Gst）为0.0527,表明牦牛亚群体间遗传分化水平很低。采用邻近结合法构建聚类图和模糊聚类分析表明,5个牦牛品种分为两大类,其中斯布牦牛、西藏高山牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛为一大类,九龙牦牛为一类。研究结果将为中国地方牦牛品种的保护和利用提供重要的理论依据。     

运用微卫星DNA标记分析我国野生鹌鹑遗传多样性

运用微卫星DNA标记对我国境内分布的两种野生鹌鹁（野生日本鸣鹁、野生普通鹌鹑）和家鹑群体的遗传多样性进行分析。通过计算反映群体变异的多态信息含量（PIC）、固定指数、平均杂合度、基因分化系数等相关指标,结果表明：野生普通鹌鹑群体遗传多样性更为丰富,每个座位平均检测出4．67个等位基因,群体多态信息含量和平均杂合度亦为最高,分别为0．5732和0．6621;家鹁最低,分别为0．5467和0．5933;野生日本鸣鹑介于两者之间;在3个鹌鹑群体中,野生日本鸣鹑与家鹑群体遗传多样性差异程度较小。以标准遗传距离为基础的模糊聚类分析发现：家鹑与野生日本鸣鹑群体模糊等价矩阵系数为0．937,而与野生普通鹌鹑的系数为0．738,这也表明家鹑与野生日本鸣鹁有更近的亲缘关系,进一步从分子水平上证实家鹑起源于野生日本鸣鹁。     

雷琼牛GH基因第五外显子遗传多样性及其分化

对16头雷琼牛GH基因第5外显子序列进行分析,发现了1个变异位点,定义了2种单倍型。引用巴州牦牛2个个体GH基因同源区序列并结合GenBank中牛属普通牛、其它瘤牛和牦牛3个种群与水牛1个远缘种GH基因同源区序列,分别采用邻接（NJ）法和最大简约（MP）法构建分子系统发育树,得到基本一致的拓扑结构,结果显示GH基因的分化早于雷琼牛（瘤牛）、其它瘤牛、普通牛、牦牛和水牛的分化,瘤牛物种内存在多型,同时证实了GH基因第5外显子区有着较高的突变率。     

湖羊、同羊12个同工酶座位的检测

Gene frequencies of Hu sheep and Tong sheep were obtained with “Random sampling in typical colonies of a central area“.of the 12 loci tested in Hu shpee.11 loci were polymorphic.Reliability of the estimated frequencies of 27 alleles reached 0.95 except for Po^F,Tf^A,Tfd,Hb-β^A and CAF which had reliabilities of 0.5222,0.7478,0.5222,0.6212 and 0.899,respectively,Of the 12 loci tested in Tong sheep,11 loci were polymorphic.Reliability of the estimated frequency of 25 alleles reached 0.95 except for Tf^A,Tf^E and CAF which had reliabilities of 0.931,0.6922 and 0.7924,respectively.The average heterozygosity(H) and average homozygosity(J) was computed and the J of the two sheep colonies was 0.6619 and 0.6448,respectively.Consistent with our conclusions based on genetic data,previous research divided the native sheep populations of East and South Central Asia into three group:the “mongolian group“ “south-Asian group“and “European group“ .Consequently,the degree of genetic similarity between populations and known groups would seem to provide a reliable means of determining the genetic relationships between populations and may reflect the true genetic origin of Hu sheep and Tong sheep in China.     

中缅树鼩形态性状的遗传制约性初步研究

树鼩是一种在医学和生物学上用途广泛的实验动物遗传资源。主要以上海市肿瘤研究所购自云南昆明地区的35只中缅树鼩及其实验室条件下繁殖的G1代为试验素材,对涉及形态性状遗传制约性的一些指标进行分析, 应用Rife-Buranamanas 定律分析中缅树鼩涉及毛色等诸多具有遗传制约性的外貌特征的显隐性关系,得出中缅树鼩典型的外貌特征为野生型毛色有季节性红斑、白腹、没有白眼圈、掌底肤色为肉色、耳朵不竖、圆形的尾尖、两侧乳房每对之间的连线分别与体轴线垂直。 Abstract : Tree shrew is a kind of excellent experimental animal resource in medical science and biology . In this paper, 35 Tupaia blangeri chinensises (TBCs) captured from Kunming,Yunnan province were investigated. We analyzed hereditary conditionality index about some morphological characters. According to Rife-Buranamanas law, We analyzed the appearance characteristics with hereditary conditionality including color of fur, orbit etc.. The results showed the following: wild fur with seasonal red spot, white fur of abdomen, non-white orbit, fleshcolor palm, non-cocked ear, round tip tail, and the line between the breasts of both sides in a vertical position with axis line.     

以Cytb基因部分序列分析大额牛系统地位及其种群现状

对12头大额牛Cytb基因部分序列447bp进行分析,共发现33个变异位点,定义了4种单倍型;结合GenBank中牛属普通牛、瘤牛、牦牛和印度褐牛4个近缘种的Cytb基因同源区序列进行分析,以水牛作为外群,分别采用邻接(NJ)法和最大简约(MP)法构建分子系统发育树,得到基本一致的拓扑结构,结果表明大额牛是独立于普通牛、瘤牛和印度褐牛之外的Bos属的一个独立的种。同时还指出目前我国有相当比例的大额牛受到外来物种的入侵,我国的大额牛保护工作正面临非常严峻的考验。     

中国野生鹌鹑群体遗传共适应特性研究

随机抽取迁飞滞留季节捕获的野生日本鸣鹑40只、野生普通鹌鹑62只和家鹑40只, 采用蒙特卡罗模拟法检验群体遗传不平衡, 运用微卫星DNA标记对两种野生鹌鹑和家鹑群体的遗传共适应特性进行分析, 在3个鹌鹑群体中证实存在遗传共适应特性; 同时构建中性位点遗传共适应的统计模型, 分析遗传共适应特性在分子水平上的效应, 结果表明: 遗传共适应主导了野生日本鸣鹑、野生普通鹌鹑和家鹑群体的遗传不平衡状态, 分别有16.67%, 9.66%和10.05%的非等位基因组合因遗传共适应的影响处于遗传不平衡或极不平衡状态, 几乎所有检测的位点都存在遗传共适应特性, 其在分子水平上的作用更加显著, 维持着群体中大量的稳定多态现象. 这一结果丰富了群体遗传不平衡的概念和内涵, 为了解除连锁之外, 另一重要因素——遗传共适应对群体遗传不平衡的作用提供了科学的依据; 同时也为阐明我国野生鹌鹑的系统地位以及为评价、保护和利用我国野生鹌鹑这一宝贵遗传资源打下基础.     

中国蒙系绵羊品种间的基因流动

利用结构基因座和微卫星标记分析了中国蒙系绵羊4个品种间的基因流动情况。结果显示, 由结构基因座得出的遗传分化系数在0.0164 ~ 0.0455之间, 由微卫星位点得出的遗传分化系数在0.0107 ~ 0.0239之间, 说明遗传变异绝大部分存在于品种内, 蒙系绵羊品种间的遗传分化水平很低。结构基因座(N_m = 7.971)和微卫星位点(N_m = 15.732)都反映出品种间的基因流通畅。品种间的遗传差异与地理距离之间无直接相关关系。初步推断我国蒙系绵羊品种间的遗传分化主要是自然选择(生境异质性)作用的结果。     

8个亚洲水牛群体的遗传结构分析

应用13个微卫星标记结合荧光–多重PCR技术, 对德昌水牛、兴隆水牛、富钟水牛、温州水牛、东流水牛、福安水牛和两个引进品种摩拉水牛、尼里－拉菲水牛进行遗传结构分析。结果表明: 8个水牛群体在13个微卫星座位中共检测到157个等位基因, 其中7个群体具有各自的特有等位基因, 其和为23; 8个群体的有效等位基因数在2.2908～4.2308之间, 杂合度在0.4951～0.7194之间, 多态信息含量在0.4495～0.6776之间; 有11个座位为高度多态座位, 是适合分析水牛遗传多样性的多态标记; 聚类分析表明富钟水牛和东流水牛先聚在一起, 再与兴隆水牛聚在一起, 然后与温州水牛和福安水牛聚在一起, 德昌水牛独自聚为一类; 两个引进品种聚为一类。     

利用12个血液蛋白和非蛋白标记分析同羊起源及系统地位

采用典型群随机抽样在陕西省白水县抽取同羊样本。采用淀粉凝胶和醋酸纤维薄膜检测12个的结构基因座位的遗传多型性,结果在同羊中发现10个多型座位：运铁蛋白（Tf）、碱性磷酸酶（Alp）、亮氨酸氨肽酶（Lap）、芳基酯酶（Ary-Es）、血红蛋白β（Hb-β）、X-蛋白（X-p）、碳酸酐酶（CA）、过氧化氢酶（Cat）、苹果酸脱氢酶（MDH）和赖氨酸（Ly）;而白蛋白（Al）和后白蛋白（Po）为单态。采用遗传贴近度和系统关系聚类分析两种方法分析同羊起源及系统地位。结果表明两种方法均支持同羊属于蒙古羊系统,同羊起源于蒙古羊,这与同羊的育成史实相符。和聚类分析方法相比,遗传贴近度分析方法可以更为有效地用于中亚以东南绵羊群体的血统判别,可以更有效地反映同羊的育成过程。