苗期玉米叶片光合特性对水分胁迫的响应

以2个抗旱性不同的玉米品种为材料进行盆栽试验,在苗期设置4个水分梯度,研究气体交换和叶绿素荧光参数及光响应特征。结果表明:随水分胁迫的加剧,除细胞间CO2浓度(Ci)和非光化学淬灭(qN)上升外,其它参数均下降,先玉335(XY335)各参数的变化幅度小于陕单902(SD902);轻度胁迫下品种间气体交换参数差异最大,严重干旱下叶绿素荧光参数差异最大;净光合速率(Pn)和相对电子传递速率(rETR)的光响应曲线拟合结果显示,水分胁迫导致玉米叶片最大光合速率和光能利用率下降,XY335各参数的下降幅度小于SD902;轻度干旱下Pn光响应拟合参数品种间差异最大,严重干旱下rETR光响应拟合参数差异最大。综上表明,水分胁迫导致玉米叶片对强光的敏感性增加,干旱和光抑制对光系统Ⅱ造成的叠加伤害随干旱加重和品种抗旱性弱而加剧,是制约光合作用的主要原因;旱区强光下的玉米幼苗应及时补水,以避免严重干旱和高光强的叠加伤害。     

乳腺癌发生的特征基因筛选及模式识别

本文选取癌症基因组图谱数据库的乳腺癌样本作为数据集,在全基因组的水平上研究乳腺癌病人从正常到发病Ⅰ期基因表达的变化,寻找与乳腺癌发病密切相关的特征基因,建立乳腺癌发生的模式识别分类方法,为乳腺癌预防及早期诊断提供理论支持.研究中,综合利用相关性、t检验、置信区间等统计学方法,建立乳腺癌发生特征基因筛选方法,获得与乳腺癌发生具有显著性差异的特征基因336个.通过机器学习方法建模,得到的分类准确率能达到98%以上,与之前乳腺癌相关的研究相比,准确率更高.同时采用KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析得到与基因显著相关(P0.05)的通路有8个,GO(gene ontology)基因功能富集分析显示与基因显著相关(P0.05)的功能有18个.最后对映射在8个通路中的一部分基因进行简要功能分析,说明了其在调控水平上的密切关系,表明识别的特征基因在乳腺癌的发生过程中有重要的作用,这对了解乳腺癌发病机理以及乳腺癌的早期诊断非常重要.     

肺鳞状细胞癌特异性甲基化候选诊断标志物的识别

甲基化异常是肿瘤早期的频发事件,DNA甲基化随着时间的推移相对稳定,并且可以在血液中非侵入性地检测到,因此DNA甲基化具有成为癌症早期诊断生物标志物的巨大潜力.为了找到肺鳞状细胞癌(LUSC)潜在的诊断标志物,本文提出了一种LUSC特异性候选诊断标志物的识别方法,使用癌症基因组图谱数据库(TCGA)的LUSC的甲基化数据集,通过比较LUSC与正常肺组织和其他癌症类型,得到了6个LUSC特异性甲基化位点,使用支持向量机建立诊断模型,采用六折交叉划分数据集,验证特异性标志物的有效性. 6个标志物的组合在预测LUSC方面达到约93%～99%的灵敏度,在排除正常组织时达到100%的特异性,在排除其他癌症时达到约99%的特异性.我们的研究为LUSC的早期诊断提供了潜在的生物标志物.