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研究真核蛋白质的亚细胞位点是了解真核蛋白质功能,深入研究蛋白质相关信号通路内在机制的基础。同时,可以为了解
疾病发病机制及为新药研发提供帮助。因此,研究真核蛋白质的亚细胞位点意义十分重大。随着基因组测序的完成,真核蛋白质
序列信息增长迅速,为真核蛋白质亚细胞位点的研究提出了更多的挑战。传统的实验法难以满足蛋白质信息量迅速增长的需求。
而采用生物信息学手段处理大规模数据的计算预测方法,可在较短时间内获得大量真核蛋白质亚细胞位点信息,弥补了实验法
的不足。因此,运用计算预测法预测真核蛋白质的亚细胞位点成为生物信息学领域的研究热点之一。本文主要从提取真核蛋白质
的特征信息、计算预测方法及预测效果的评价三个方面,介绍近年来真核蛋白质亚细胞位点预测的研究进展。 相似文献
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哺乳动物皮肤中真皮内的胶原蛋白含量约占70%,主要是I型、III型和少量V型胶原蛋白。利用稀酸溶解和酶法提取了大鼠皮肤中的总胶原蛋白,将胶原蛋白粗提品在60℃变性后用胰蛋白酶进行降解,液相色谱/质谱联用法分析两种胶原蛋白的特征多肽,并研究不同生长期大鼠皮肤中I型和III型胶原蛋白相对含量。结果表明,大鼠皮肤中的III型胶原蛋白的相对含量随生长期延长逐渐降低,而I型胶原蛋白的相对含量逐渐升高,8周后两种胶原蛋白的比例趋于稳定。表明使用高效液相色谱/质谱联用法分析组织中的胶原蛋白类型及其动态变化具有可行性,为更好的临床应用提供实验基础。 相似文献
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液相色谱/质谱联用法分析不同年龄鼠皮肤中I型、III型胶原蛋白相对含量 总被引:1,自引:0,他引:1
哺乳动物皮肤真皮中胶原蛋白含量约为70%,主要为是I型、III型胶原蛋白,本实验利用稀酸溶解和酶法提取了大鼠皮肤中的总胶原蛋白,将胶原蛋白粗提品在60℃变性后用胰蛋白酶进行降解,液相色谱/质谱联用法分析了两种胶原蛋白的特征多肽,利用特征多肽比较了不同生长期大鼠皮肤中I型和III型胶原蛋白相对含量。结果表明,大鼠皮肤中的III型胶原蛋白的相对含量随生长期延长逐渐降低,而I型胶原蛋白的相对含量逐渐升高,8周后两种胶原蛋白的比例趋于稳定。本实验结果表明使用高效液相色谱/质谱联用法分析组织中的胶原蛋白类型及其动态变化具有可行性,为更好的临床应用提供了实验基础。 相似文献
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目的:慢性阻塞性肺疾病患者白介素-6基因的提取及668C/G位点基因分型。慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一个复杂的全身性疾病,其发病是多基因遗传、环境等因素共同作用的结果。它的特点是既有肺的局部炎症也有全身性炎症。许多研究提示COPD患者出现血循环中的炎症细胞活化和炎症细胞因子水平增高。方法:从COPD患者外周血提取基因组DNA,微量核酸测定仪检测核酸浓度,通过聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)扩增目的基因白介素-6基因片断,用胶回收的方法回收和纯化白介素-6基因,并用限制性内切酶剪切白介素-6基因,检测IL-6基因668C/G位点的基因型。结果:COPD患者668C/G位点基因分型可分为CC,CG,GG基因型。结论:成功进行了IL-6基因668C/G位点的基因型分析,为之后进一步进行多态性分析研究奠定基础。 相似文献
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提取高质量的 DNA是对苔藓植物遗传多样性进行研究的基础。该文以苔藓植物为试材 ,用 5种方法 ,即快速提取法、改良 CTAB法、CTAB法、SDS法及高盐法 (第一种为自行设计 ,第二种是对原有方法的改进 )对苔藓植物 DNA提取方法进行了比较研究。结果表明 ,快速提取法和改良 CTAB法是 2种适合于苔藓植物 DNA提取的方法。这 2种方法提取的 DNA浓度和纯度均比较高 ,凝胶电泳显示无明显降解现象 ,适宜作为 PCR扩增的模板 ,并成功地进行了 RAPD扩增。 相似文献
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