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1.
采用聚合酶链式反应(PCR)技术对我国南海海域5个地点(三亚、深圳、阳江、湛江、北海)的野生斑节对虾100个个体的mtDNA 16S rRNA序列进行扩增,扩增产物经纯化后进行测序.用Clustal_X排序软件对所得的100个mtDNA 16S rRNA序列进行比对.通过ARLEQUIN软件对所得100个mtDNA 16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型.19单倍型序列的碱基组成显示出较高的A T比例(69.0%).19种单倍型序列的遗传距离在0.002~0.033.根据构建的单倍型进化关系网,5个地点群体中的单倍型呈现一种混杂的分布格局.此外,根据单倍型在5个地点群体出现的频率和单倍型进化关系网,单倍型7是最为原始的单倍型,其他18种单倍型均起源于单倍型7.  相似文献   
2.
采用RACE-PCR方法从斑节对虾(Penaeus monodon)总RNA反转录产物中获得了502 bp的金属硫蛋白(Pm-MT)基因cDNA序列。该序列包含69 bp的5′非编码区(UTR)和256 bp的3′非编码区(UTR)以及177 bp的开放阅读框(ORF),可编码58个氨基酸。在其编码的氨基酸序列中半胱氨酸含量丰富,不含芳香族氨基酸,存在有无脊椎动物金属硫蛋白的特征序列CKCXXXCXCX,预测的分子量约为6.05 kD,理论等电点7.75。序列比对分析表明Pm-MT与北美淡水蟹(Pacifastacus leniusculus)的相似性高达91.4%,与美国龙虾(Homarus americanus)的同源性最高为84.5%。实时定量PCR显示在所检测组织中,Pm-MT的mRNA在卵巢的表达量最高,其次为胃、肠、心脏、脑和肝胰腺;Pm-MT的mRNA在斑节对虾6个不同发育期的卵巢中的表达量都很高,其中在Ⅱ期卵巢中的表达量最高。实验所得结果以期为Pm-MT进一步在卵巢发育的功能研究提供基础材料。  相似文献   
3.
斑节对虾α-淀粉酶基因的克隆及其表达分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了研究斑节对虾α-淀粉酶基因的结构和生物学功能, 根据原实验室构建的斑节对虾(Penaeus monodon) cDNA文库得到的EST序列, 利用RACE技术获得了斑节对虾α-淀粉酶基因(PmAmy)的cDNA全长序列。该基因序列全长2465 bp, 包括2175 bp的开放阅读框, 编码724个氨基酸, 分子总量为78.9 kD, 理论等电点为4.66。PmAmy包含一个α-淀粉酶家族保守的A结构域(Thr34-Ser410)和一个C结构域(Glu420-Ala496)。PmAmy氨基酸序列与其他物种的相似性为47%—99%, 利用PmAmy构建的进化树显示斑节对虾和凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的亲缘关系最近。基因表达结果显示PmAmy在肝胰腺组织中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。斑节对虾PmAmy基因在卵巢发育的过程中均有表达, 表达量有所变化, 虽然没有发现显著性的差异(P=0.09)。斑节对虾PmAmy在整个生长阶段的检测中都有表达, 其中幼体发育过程中存在显著性差异, 糠虾时期PmAmy表达量显著高于无节幼体、溞状幼体和仔虾时期(P<0.05)。以上实验结果初步说明了PmAmy可能与斑节对虾的幼体发育相关。  相似文献   
4.
微生物制剂对斑节对虾亲虾池异养细菌的影响   总被引:2,自引:0,他引:2  
研究了施用10 mg·kg-1光合细菌以及1、2和3 mg·kg-1芽孢杆菌制剂对斑节对虾亲虾培育池水体异养细菌和弧菌数量的影响.结果表明:在试验初期,试验组和对照组水体总异养细菌和弧菌数量都明显上升;试验后期,试验池水体异养细菌和弧菌数量均明显下降,明显低于对照池;施用10 mg·kg-1光合细菌能显著抑制亲虾池水体异养细菌的生长(P<0.01);施用3 mg·kg-1芽孢杆菌对亲虾池水体弧菌数量的抑制效果最好(P<0.01).  相似文献   
5.
铲鲟微卫星引物对中华鲟的适用性研究   总被引:19,自引:1,他引:18  
将21对铲鲟(Scaphirhynchus platorynchus Rafinesque)的微卫星引物在中华鲟(Acipenser sinensis Gray)基因组DNA上进行PCR扩增,14对(约占67%)引物得到了扩增产物,其中有10对(约占48%)表现为多态性,但只有2对(9.5%)引物SPl-100和Spl-168的多态性较高,且带型清晰,可直接作为分子标记应用于相关的研究,此外,对具有特异性扩增,但有Stutter band现象的4对引物的部分可分离PCR产物进行了回收和测序,并对其中的3对引物的序列进行了重新设计,最后得到两对可应用于中华鲟的引物As-100和Spl0-170b,研究结果表明,对相近种的微卫星引物进行优化设计来获得一个物种的微卫星引物是一条简捷有效的途径。  相似文献   
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